在小RNA上釋放TIGER
努力探索小RNA(sRNA)的景觀 - 短時(shí)間難以理解的RNA分子 - 通常使用高通量測(cè)序(sRNA-seq)。由于缺乏識(shí)別，量化和分析sRNA-seq數(shù)據(jù)集中所有不同sRNA的工具，這些努力受到阻礙。
Kasey Vickers博士及其同事現(xiàn)在開(kāi)發(fā)了一種名為TIGER(細(xì)胞外sRNA的整合基因組分析工具)的新分析方法。為了證明這種工具的強(qiáng)大功能，他們對(duì)小鼠脂蛋白，膽汁，尿液和肝臟進(jìn)行了sRNA-seq。在最終的數(shù)據(jù)集中，TIGER能夠識(shí)別大約60%的脂蛋白上的sRNA和超過(guò)85%的膽汁，尿液和肝臟中的sRNA。
研究人員發(fā)現(xiàn)脂蛋白上的大多數(shù)sRNA是來(lái)自微生物組和環(huán)境中細(xì)菌來(lái)源的非宿主sRNA。
這項(xiàng)研究在細(xì)胞外囊泡雜志上發(fā)表，揭示了新的脂蛋白和生物流體sRNA，并表明TIGER非常適合sRNAs的研究。
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