人類(lèi)DNA比DNA單細(xì)胞生命更柔軟
單細(xì)胞生物體比人類(lèi)和水稻等多細(xì)胞生物體具有更硬的DNA。理論物理學(xué)家第一次設(shè)法模擬全基因組中的折疊以得出這個(gè)結(jié)論。2月7日在生物物理期刊上發(fā)表。局部剛度DNA使用四個(gè)基本字母存儲(chǔ)信息,這些基本字母編碼排列我們體內(nèi)所有過(guò)程的蛋白質(zhì)。每個(gè)長(zhǎng)約2米的DNA分子都精心盤(pán)繞以適應(yīng)細(xì)胞內(nèi)部。剛度的局部變化允許更少或更多的包裹,從而影響每組字母的可讀性。基因中的這些機(jī)械線索提供了第二層信息,正如萊頓物理學(xué)家Helmut Schiessel在理論上早些時(shí)候所證明的那樣。
一般規(guī)則
現(xiàn)在,在后續(xù)研究中,Schiessel和他的同事改進(jìn)了他們的計(jì)算機(jī)模型,允許他們計(jì)算50種物種的全基因組中的折疊。這導(dǎo)致了生物物理學(xué)中新的一般規(guī)則的發(fā)現(xiàn):像酵母這樣的單細(xì)胞物種的特征是在基因開(kāi)始時(shí)DNA序列中存在僵硬的延伸,而像人類(lèi),小鼠或斑馬魚(yú)這樣的多細(xì)胞生命體具有柔軟的伸展。“單細(xì)胞物種需要在它們所擁有的一個(gè)細(xì)胞中獲得所有基因,”Schiessel解釋說(shuō)。“因此,它需要堅(jiān)硬的DNA,因此很容易讀出。人類(lèi)有許多不同類(lèi)型的細(xì)胞,我們發(fā)現(xiàn)這反映在軟DNA中。”
全基因組
為了發(fā)現(xiàn)它們,研究人員對(duì)許多模擬基因序列進(jìn)行了平均分析,并在新基因開(kāi)始時(shí)觀察了剛度。與現(xiàn)實(shí)生活實(shí)驗(yàn)的比較表明該模型有效。Schiessel:“我們的模擬比實(shí)驗(yàn)快得多,因此我們能夠首次分析幾種生命形態(tài)的完整基因組。您可以從我們的發(fā)現(xiàn)中認(rèn)為DNA越軟,生命形式越復(fù)雜,但足夠有趣,我們發(fā)現(xiàn)水稻含有我們分析的所有物種中最軟的DNA。“
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