新實驗室技術(shù)可以識別我們的基因是影響DNA片段留在我們的遺傳密碼的病毒,一項新的研究發(fā)現(xiàn)。病毒一直知道繁殖利用遺傳細胞入侵的機械。作為這一進程的一部分,隨著時間的推移,這些微生物留下成千上萬的DNA序列,稱為轉(zhuǎn)座子,整個遺傳物質(zhì)(基因)在許多生命形式,包括老鼠和人類,該研究的作者說。研究建立了幾十年前的想法,一些病毒插入到行動中扮演一個角色基因.

決定轉(zhuǎn)座子調(diào)節(jié)基因,然而,已經(jīng)被證明是一個挑戰(zhàn),因為轉(zhuǎn)座子可能會影響附近的一個基因或一個坐落在DNA分子鏈。基因組生物學(xué),12月13日在網(wǎng)上發(fā)表的新研究描述方法,獲取更多信息的位置和影響病毒插入基因組中,識別基因可能控制活動轉(zhuǎn)座子(我們沉默的大多數(shù)細胞的防御機制)。

“從我們的研究的一個有趣的發(fā)現(xiàn)是,一個轉(zhuǎn)座子可以控制多個基因,一個基因可以由多個轉(zhuǎn)座子,增加的復(fù)雜性潛在的轉(zhuǎn)座子對健康和疾病的影響,“高級研究作者簡. Skok,博士,桑德拉和愛德華·h·邁耶的放射腫瘤學(xué)教授,紐約大學(xué)Langone健康的波爾馬特癌癥中心。“此外,病毒插入來自同一家庭優(yōu)先相互作用,可能會加強他們的影響基因的活動。”

遺傳的現(xiàn)實

幾十年來DNA被發(fā)現(xiàn)后,研究人員大多認(rèn)為基因在基因方面,DNA的片段或序列構(gòu)建蛋白質(zhì)在細胞編碼指令。然后科學(xué)家發(fā)現(xiàn)基因只占2%的DNA和大多數(shù)遺傳復(fù)雜性源于絕大non-gene代碼,影響基因開啟或關(guān)閉的時候。此外,一半的non-gene代碼發(fā)現(xiàn)來自病毒DNA的插入。因此,作者說,遺傳變異,以及潛在的致病錯誤,發(fā)生在轉(zhuǎn)座子和基因。

目前的結(jié)果是基于發(fā)現(xiàn)的DNA片段,稱為增強劑,控制基因活性。這些增強劑可以分開他們的目標(biāo)基因通過線性DNA鏈很長一段距離,但可以卷曲在3 d空間與一段鏈的形成循環(huán)。證據(jù)然后出現(xiàn)這些循環(huán)增強劑可能部分病毒轉(zhuǎn)座子序列。

但那些試圖理解這些增強子的作用所面臨的一個問題。

轉(zhuǎn)座子插入發(fā)生在許多網(wǎng)站,因此重復(fù)相同的DNA密碼(不是唯一的)。然而,受歡迎的全基因組關(guān)聯(lián)研究依賴于找到一個之間的聯(lián)系,獨特的DNA片段和疾病的風(fēng)險。因此,重復(fù)序列通常被忽略,因為它是不清楚哪一個多個插入站點交互與特定疾病相關(guān)基因。

實驗證據(jù)支持的想法施加影響,增強劑必須使身體接觸與他們通過線圈形成目標(biāo)基因。識別這些不同的DNA之間的相互作用成為可能在2002年與一種稱為染色體構(gòu)象捕獲的技術(shù)的發(fā)展。

當(dāng)前的研究描述了兩種變體在這技術(shù),統(tǒng)稱為4 tran,利用轉(zhuǎn)座子的重復(fù)性質(zhì)來捕獲它們的交互。技術(shù)提供直接證據(jù)表明,一些基因轉(zhuǎn)座子發(fā)揮遠程控制循環(huán)。

新技術(shù)之一,4 tran-pcr,被證明是能夠發(fā)現(xiàn)所有交互包括轉(zhuǎn)座子家族的成員,包含一個特定的DNA序列,使研究人員能夠數(shù)成百上千個這樣的轉(zhuǎn)座子發(fā)生的地方。方法證明了轉(zhuǎn)座子更有可能與DNA相互作用在當(dāng)?shù)厣鐓^(qū)(拓?fù)潢P(guān)聯(lián)域),而且他們參加遠程交互激活狀況的隔間。

第二個技術(shù),捕捉4 tran,附加探測病毒家族的每個成員,與其他技巧結(jié)合在一起,使團隊確定任何單一的影響轉(zhuǎn)座子復(fù)制在一個特定的基因或基因。例如,研究表明,一些病毒留下的7200份重復(fù)DNA MER41家庭,感染我們的靈長類祖先6000萬年前,現(xiàn)在作為增強劑,打開循環(huán)免疫系統(tǒng)通過遠程DNA基因聯(lián)系。具有諷刺意味的是,目標(biāo)基因在這種情況下采取行動,戰(zhàn)斗,所有的事情,病毒。前進,團隊已經(jīng)開始尋求識別網(wǎng)絡(luò)實驗的轉(zhuǎn)座子和基因之間的相互作用不同的癌細胞比健康細胞。