蘭花Apostasia shenzhenica的基因組測序
(Phys.org) - 一個大型國際研究團隊對蘭花Apostasia shenzhenica的基因組進行了測序。在他們發(fā)表在Nature雜志上的論文中,該團隊描述了他們使用的方法以及他們在此過程中學到的知識。正如研究人員指出的那樣,蘭花在當今世界普遍存在是輕描淡寫的,它們目前構(gòu)成了所有開花植物物種的大約10%,并且除了地球上最極端的棲息地外,它們已經(jīng)被殖民化了。由于其強大的遷移和變化能力以適應不同的條件,它多年來引起了科學家的興趣。在這項新的努力中,研究人員將他們的工作重點放在了中國東南部發(fā)現(xiàn)的一種蘭花Apostasia shenzhenica上。它主要是綠色的,有黃色的花朵。了解花的基因組構(gòu)成揭示了它進化為適應新環(huán)境的方式。
研究人員報告稱,他們使用10x基因組學支架進行短讀和長讀測序,以開發(fā)植物的基因組序列。他們還報告說,他們使用他們的工作結(jié)果將植物與其他蘭花進行比較,以分離出與使用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)不同的部分相同的部分。
研究小組發(fā)現(xiàn),A。shenzhenica提供了強有力的證據(jù)證明它包含在蘭花科中 - 大部分基因組是其他蘭花類型的虛擬拷貝。他們還發(fā)現(xiàn),數(shù)百萬年前,它與其他蘭花分開,接近蘭花第一次存在的時間點。他們還發(fā)現(xiàn)蘭花經(jīng)歷了一個主要的滅絕期,之后植物分化并隨后演變成五個亞科。他們認為,在此期間,著名的“嘴唇”等特征得以發(fā)展。
該小組的研究結(jié)果表明,該植物是進一步研究的良好候選者,因為它可能提供進化線索,例如導致蘭花有花粉癥(花粉塊)和比其他植物更輕的種子的因素。它也可能解釋另一個眾所周知的特性 - 使用其他植物獲得支持的能力。
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