細(xì)菌來(lái)反射聲納信號(hào)
在1966年的科幻電影Fantastic Voyage中,一艘潛艇縮小并注入科學(xué)家的身體,以修復(fù)他大腦中的血凝塊。雖然這部電影可能仍然是虛構(gòu)的,但加州理工學(xué)院的研究人員正朝著這個(gè)方向邁進(jìn):他們第一次創(chuàng)造出能夠反射聲波的細(xì)菌細(xì)胞,讓人聯(lián)想到潛艇如何反射聲納來(lái)揭示它們的位置。最終的目標(biāo)是要能夠治療細(xì)菌注射到病人體內(nèi),例如,如益生菌,以幫助腸道的治療疾病或腫瘤靶向治療,然后用超聲波機(jī)與打工程菌的聲波來(lái)生成圖像揭示了微生物的位置。這些照片可以讓醫(yī)生知道治療方法是否能夠在體內(nèi)正確的位置進(jìn)行,并且工作正常。“我們正在設(shè)計(jì)細(xì)菌細(xì)胞,這樣它們就可以將聲波反射回我們,讓我們知道它們的位置,就像另一艘船正在尋找它時(shí)船舶或潛艇散布聲納的方式,”Schlinger化學(xué)工程助理教授Mikhail Shapiro說(shuō)。學(xué)者和遺產(chǎn)醫(yī)學(xué)研究所研究員。“我們希望能夠問(wèn)細(xì)菌,'你在哪里,你在做什么?' 第一步是學(xué)會(huì)可視化和定位細(xì)胞,下一步是與它們溝通。“結(jié)果將發(fā)表在1月4日的“ 自然 ”雜志上。主要作者是Raymond Bourdeau,他是Shapiro實(shí)驗(yàn)室的前博士后學(xué)者。
使用細(xì)菌作為藥物的想法并不新鮮。已經(jīng)開(kāi)發(fā)出益生菌來(lái)治療腸道疾病,例如腸易激病,并且一些早期研究已經(jīng)表明細(xì)菌可以用于靶向和破壞癌細(xì)胞。但是,可視化這些細(xì)菌細(xì)胞以及與它們進(jìn)行交流 - 既可以收集關(guān)于體內(nèi)正在發(fā)生的事情的信息,也可以讓細(xì)菌指示下一步該做什么 - 這是不可能的。依賴于光的成像技術(shù) - 例如拍攝標(biāo)記有“報(bào)告基因”的細(xì)胞的圖片,所述“報(bào)告基因”僅編碼綠色熒光蛋白,僅在從身體移除的組織樣本中起作用。這是因?yàn)楣獠荒軡B入細(xì)菌細(xì)胞所在的腸道等深層組織。
夏皮羅希望用超聲技術(shù)解決這個(gè)問(wèn)題,因?yàn)槁暡梢愿钊氲剡M(jìn)入身體。他說(shuō),大約六年前,當(dāng)他了解到有助于調(diào)節(jié)生物體浮力的水棲細(xì)菌中的充氣蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)時(shí),他有一個(gè)尤里卡時(shí)刻。夏皮羅假設(shè)這些被稱為氣囊的結(jié)構(gòu)能夠以一種使其與其他類型細(xì)胞區(qū)分開(kāi)來(lái)的方式反彈聲波。事實(shí)上,夏皮羅和他的同事們證明,氣體囊泡可以通過(guò)超聲波在小鼠的腸道和其他組織中成像。該團(tuán)隊(duì)的下一個(gè)目標(biāo)是將用于從水棲細(xì)菌制造氣囊的基因轉(zhuǎn)移到不同類型的細(xì)菌 - 大腸桿菌中,其通常用于微生物治療,例如益生菌。“我們想教大腸桿菌 細(xì)菌自己制造氣囊,”夏皮羅說(shuō)。“自從我們意識(shí)到氣體囊泡的潛力以來(lái),我一直想做到這一點(diǎn),但是我們?cè)诼飞嫌龅搅艘恍┱系K。當(dāng)我們最終讓系統(tǒng)工作時(shí),我們欣喜若狂。”
該小組遇到的挑戰(zhàn)之一涉及將氣囊的遺傳機(jī)制轉(zhuǎn)移到大腸桿菌中。他們首先嘗試轉(zhuǎn)移從稱為魚腥藻(Anabaena flos-aquae)的水棲細(xì)菌中分離的氣囊基因,但這不起作用 - 大腸桿菌未能制成囊泡。他們?cè)俅螄L試使用來(lái)自大腸桿菌(一種叫做巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium))的近親的氣囊基因。這也沒(méi)有成功,因?yàn)楫a(chǎn)生的氣泡太小而不能有效地散射聲波。最后,該團(tuán)隊(duì)嘗試了來(lái)自這兩個(gè)物種的混合基因 - 并且它起作用。該大腸桿菌對(duì)自己做出的氣體泡。
氣囊泡基因編碼的蛋白質(zhì)在構(gòu)建最終的囊泡結(jié)構(gòu)時(shí)起到磚或起重機(jī)的作用 - 一些蛋白質(zhì)是囊泡的構(gòu)建塊,而一些有助于實(shí)際組裝結(jié)構(gòu)。“基本上,我們發(fā)現(xiàn)我們需要來(lái)自魚腥藻(Anabaena flos-aquae)的磚和巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium)的起重機(jī),以便大腸桿菌能夠制造氣囊,”Bourdeau說(shuō)。
該團(tuán)隊(duì)的后續(xù)實(shí)驗(yàn)證明,使用超聲波確實(shí)可以對(duì)工程化的大腸桿菌進(jìn)行成像并定位于小鼠的腸內(nèi)。“這是第一個(gè)用于超聲成像的聲學(xué)報(bào)告基因,”夏皮羅說(shuō)。“我們希望它能最終為超聲波提供綠色熒光蛋白質(zhì)在基于光學(xué)的成像技術(shù)方面的作用,這種技術(shù)真正徹底改變了以前無(wú)法實(shí)現(xiàn)的細(xì)胞成像。”研究人員表示,這項(xiàng)技術(shù)應(yīng)該很快就可以用于研究動(dòng)物的科學(xué)家,盡管開(kāi)發(fā)這種人類使用方法還需要很多年。
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