抗生素耐藥性細(xì)菌破譯融化
隨著全球抗生素耐藥性蔓延,有一個(gè)強(qiáng)大的新技術(shù)需要研究細(xì)菌。EMBL的研究人員適應(yīng)現(xiàn)有的技術(shù)來(lái)研究蛋白質(zhì)的融化行為,以便它可以用于研究細(xì)菌。分子系統(tǒng)生物學(xué)發(fā)表了他們r(jià)esults-allowing全球研究人員開(kāi)始使用技術(shù)在7月6日。
熱蛋白質(zhì)組分析(TPP)是在2014年開(kāi)發(fā)的(科學(xué)Savitski et al .,2014),并使科學(xué)家們能夠比較所有蛋白質(zhì)的融化行為前后細(xì)胞或生物擾動(dòng),如藥物的管理。TPP適應(yīng)細(xì)菌,它現(xiàn)在可以用于研究大多數(shù)蛋白質(zhì)的活動(dòng)和建筑在細(xì)菌細(xì)胞而活著。Andre Mateus EMBL的博士后在Savitski和Typas組織工作,領(lǐng)導(dǎo)了這項(xiàng)研究。
細(xì)菌的熱
人體停止運(yùn)轉(zhuǎn)時(shí)溫度高于42°C,大腸桿菌仍成長(zhǎng)定期45°C。“我們發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的細(xì)菌細(xì)胞不太寬容比在細(xì)胞表面熱,“米哈伊爾·Savitski說(shuō)。“令人驚訝的是,蛋白質(zhì)的位置比其他的融化行為預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)相互作用。”
還在TPP,科學(xué)家可以研究藥物對(duì)細(xì)菌的影響。Protein-drug交互通常增加蛋白質(zhì)的耐熱性,導(dǎo)致更高的熔點(diǎn)。因此,比較耐熱性藥物治療和未經(jīng)處理的細(xì)菌細(xì)胞有助于識(shí)別目標(biāo)的抗菌藥物,但也破譯細(xì)菌細(xì)胞如何屈服于藥物或者試圖繞過(guò)它的行動(dòng)。
耐藥機(jī)制
“在一個(gè)特定的情況下,我們能夠闡明小說(shuō)耐藥性機(jī)制,”安德烈Mateus說(shuō)。“細(xì)胞蛋白質(zhì)注入抗生素使用的細(xì)胞。從他們的染色體基因刪除其中一個(gè)射流泵后,細(xì)菌對(duì)許多藥物變得更加敏感,但奇怪的是對(duì)一個(gè)特定抗生素叫aztreonam。使用跨太平洋伙伴關(guān)系,我們發(fā)現(xiàn)這是由于特定的porin-a蛋白質(zhì)含量大大降低,充當(dāng)pore-used aztreonam進(jìn)入細(xì)胞。”
與其他技術(shù)相比,TPP允許科學(xué)家研究擾動(dòng)的影響成千上萬(wàn)的個(gè)體蛋白質(zhì)在短時(shí)間內(nèi)。大多數(shù)獲得insights-like vivo-would的蛋白質(zhì)的活性的變化與其他傳統(tǒng)的技術(shù)是不可能同時(shí)和許多蛋白質(zhì),研究顯示TPP的潛力細(xì)菌在細(xì)節(jié)。
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