超分辨率顯微鏡照亮了染色體之間的關(guān)聯(lián)
密蘇里州堪薩斯城 - 由于采用超分辨率顯微鏡,科學(xué)家們現(xiàn)在已經(jīng)能夠明確地識別人類染色體之間的物理關(guān)聯(lián)。這些發(fā)現(xiàn)揭示了對50多年前首次發(fā)現(xiàn)的好奇觀察的新認(rèn)識。
Stowers醫(yī)學(xué)研究所的科學(xué)家在最近在線發(fā)表于“細(xì)胞生物學(xué)雜志”的一份報(bào)告中探討了人類核型中五條染色體之間的這些物理聯(lián)系 。
“在許多類型的人類細(xì)胞中,染色體間連接可能被證明是染色體組織的一個(gè)不可或缺的主要特征,”Stowers研究員Jennifer Gerton博士說,他領(lǐng)導(dǎo)的研究小組調(diào)查了這些細(xì)胞的基礎(chǔ)和功能。聯(lián)系。
在人類基因組組織研究過程中發(fā)現(xiàn)了這種聯(lián)系。Gerton實(shí)驗(yàn)室的研究專家Tamara Potapova博士與Stowers Microscopy和Computational Biology團(tuán)隊(duì)合作,使用結(jié)構(gòu)圖像超分辨率顯微鏡(SIM)技術(shù),以納米級分辨率顯示生物樣品,并在這些研究。
該報(bào)的第一作者Potapova解釋說,當(dāng)SIM圖像始終顯示二十三個(gè)人類染色體中的五個(gè)之間存在聯(lián)系時(shí),她和她的同事們感到驚訝。“我們知道染色體的重復(fù)姐妹拷貝之間有接觸點(diǎn),但異源染色體之間沒有接觸點(diǎn),”她說。“我對為什么同樣的五條染色體在許多不同的細(xì)胞類型中顯示出連接感到著迷。”
Potapova找到了幾個(gè)先前發(fā)表的關(guān)于可能的染色體間連鎖的報(bào)告。大多數(shù)這些觀察是在細(xì)胞遺傳學(xué)研究期間進(jìn)行的,早在超分辨率顯微鏡方法出現(xiàn)之前。
1961年,英國遺傳學(xué)家馬爾科姆·A·弗格森 - 史密斯在“柳葉刀”雜志上發(fā)表了關(guān)于染色體間聯(lián)系的早期觀察。由于當(dāng)時(shí)顯微鏡的分辨率非常有限,弗格森 - 史密斯(現(xiàn)為劍橋大學(xué)的名譽(yù)教授)幾乎看不到這種聯(lián)系。然而,在“ 柳葉刀”雜志的 論文中,他寫道,他在細(xì)胞遺傳學(xué)研究中觀察到的一些染色體似乎與他們的短臂相似,就像一對“手牽著手的雜技演員”。
Stowers的研究人員意識到,顯示染色體間連接的五條染色體通過一個(gè)共享序列 - 核糖體DNA(rDNA)連接在一起。該序列編碼核糖體RNA(rRNA)分子,核糖體是核糖體的形成所必需的,核糖體是細(xì)胞的蛋白質(zhì)制造工廠。這些序列接近五種不同的人類染色體的末端,并且可以充當(dāng)雜技者的“手”,將不同的染色體保持在一起。
研究人員還檢測了許多不同人類細(xì)胞類型的rDNA連接。Potapova說,rDNA鏈接在健康和患病組織中都很普遍,這表明它們不是病理性的。
在該論文中,Stowers研究人員及其來自新加坡科學(xué),技術(shù)和研究機(jī)構(gòu)以及勞倫斯伯克利國家實(shí)驗(yàn)室的共同作者提出,染色體之間rDNA連接的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)是拓?fù)浠ユi或鏈接。
互鎖可以通過兩個(gè)因素的組合發(fā)生。第一個(gè)因素是核仁中的強(qiáng)烈轉(zhuǎn)錄活性,即細(xì)胞核中核糖體生物發(fā)生的位點(diǎn)。第二個(gè)因素是來自核仁中不同異源染色體的rDNA序列鏈的存在。由于它們在核仁擁擠的環(huán)境中非常接近,因此rDNA序列鏈可以相互碰撞。
這些鏈可以通過酶拓?fù)洚悩?gòu)酶II的作用而相互連接。為了消除由于高水平轉(zhuǎn)錄引起的超螺旋應(yīng)力,拓?fù)洚悩?gòu)酶II必須不斷地?cái)嗔巡⒅匦逻B接DNA鏈。在論文中,研究人員提出這種酶可以糾纏兩條不同染色體上rDNA區(qū)域的鏈,從而形成連接。
研究人員還確定,除了形成rDNA連接外,拓?fù)洚悩?gòu)酶II還可確保染色體分裂時(shí)解析染色體之間的rDNA連接。除拓?fù)洚悩?gòu)酶II外,研究小組還確定了調(diào)節(jié)連接的其他因素。促進(jìn)rDNA轉(zhuǎn)錄的因子增加了連接,包括 c-Myc 基因,核糖體生物發(fā)生和蛋白質(zhì)合成的全局調(diào)節(jié)因子,以及包含rDNA連接的上游結(jié)合因子(UBF)轉(zhuǎn)錄因子。
這項(xiàng)研究結(jié)果可以提供關(guān)于導(dǎo)致羅伯遜易位的染色體融合起源的線索,羅伯遜易位是人類最常見的染色體異常。羅伯遜易位是兩條含有rDNA的染色體之間的融合。連接提供的接近可能增加這些染色體在DNA中發(fā)生斷裂時(shí)最終融合在一起的可能性。Robertsonian易位可導(dǎo)致不孕癥和唐氏綜合癥等三體性。
Gerton Lab繼續(xù)研究基因組的其他區(qū)域是否參與染色體間連接。Gerton說:“這些研究的結(jié)果揭示了一種新型的染色體 - 染色體相互作用?,F(xiàn)在我們想知道除了rDNA之外的區(qū)域是否可以使用相似的機(jī)制參與這些類型的相互作用。”
其他研究貢獻(xiàn)者包括Jay R. Unruh博士,Zulin Yu博士和來自Stowers Institute的Hua Li博士,來自科學(xué)機(jī)構(gòu)的Giulia Rancati博士,新加坡的技術(shù)與研究,以及勞倫斯伯克利國家實(shí)驗(yàn)室的Martha R. Stampfer博士。
放置調(diào)查結(jié)果摘要
Stowers醫(yī)學(xué)研究所最近的研究解決了半個(gè)世紀(jì)以來對特定人類染色體之間聯(lián)系的觀察的一個(gè)謎。在最近發(fā)表在“細(xì)胞生物學(xué)雜志”上的一篇文章中 ,由Stowers Investigator Jennifer Gerton博士領(lǐng)導(dǎo)的研究小組獲得了博士學(xué)位。揭示了如何建立連接。
使用超分辨率顯微鏡,第一作者Tamara Potapova博士和合作者確定這些染色體間連鎖由核糖體DNA組成,這是在連接的染色體之間共有的序列。研究結(jié)果表明,連接受三維空間染色體的接近及其轉(zhuǎn)錄的控制,它們共同使染色體相互碰撞并互鎖。在多種細(xì)胞中檢測到連接,表明它們是染色體 - 染色體相互作用的正常類型。然而,它們可以提供關(guān)于與人類不育和發(fā)育障礙相關(guān)的染色體融合起源的線索。
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