大麥基因組測序
尋找更好的啤酒或單一麥芽蘇格蘭威士忌?加州大學(xué)河濱分校的一組研究人員可能會為您提供幫助。他們是全球77位科學(xué)家中的一員,他們對大麥的全基因組進(jìn)行了測序,這是啤酒和單一麥芽蘇格蘭威士忌的關(guān)鍵成分。這項(xiàng)研究已有10年的歷史,剛剛發(fā)表在“自然”雜志上。
“這使大麥基因組的完整程度達(dá)到了巨大的水平,”加州大學(xué)河濱分校遺傳學(xué)教授Timothy Close說。“這使得研究大麥的研究人員更容易專注于可實(shí)現(xiàn)的目標(biāo),從新品種開發(fā)到育種再到基因機(jī)械研究。”
該研究還將幫助那些與其他“谷類作物”合作的科學(xué)家,包括大米,小麥,黑麥,玉米,小米,高粱,燕麥甚至草坪草,它們和其他糧食作物一樣,都在草叢中,Close說。
大麥作為主食和發(fā)酵飲料以及動(dòng)物飼料已被使用了一萬多年。
它存在于早餐谷物和通用面粉中,有助于面包上升。麥芽啤酒賦予啤酒顏色,身體,蛋白質(zhì)以形成良好的頭部,以及發(fā)酵所需的天然糖。單一麥芽蘇格蘭威士忌僅由水和麥芽制成。
“自然”雜志上的報(bào)告提供了對麥芽制作過程至關(guān)重要的基因家族的新見解。大麥基因組序列還能夠鑒定在馴化期間易受遺傳瓶頸影響的基因組區(qū)域,這些知識有助于指導(dǎo)育種者在其作物改良工作中優(yōu)化遺傳多樣性。
十年前,由德國萊布尼茨植物遺傳與作物植物研究所的Nils Stein領(lǐng)導(dǎo)的國際大麥基因組測序協(xié)會開始組裝一個(gè)完整的大麥基因組參考序列。
這是一項(xiàng)艱巨的任務(wù),因?yàn)榇篼溁蚪M的大小幾乎是人類基因組的兩倍,其中80%由高度重復(fù)的序列組成,如果沒有相當(dāng)大的額外努力,這些序列無法準(zhǔn)確地分配到基因組中的特定位置。
本文使用多種新策略來規(guī)避這種基本限制。測序技術(shù),算法設(shè)計(jì)和計(jì)算方面的重大進(jìn)步使其成為可能。盡管如此,這項(xiàng)工作仍然使世界各地的團(tuán)隊(duì) - 包括德國,澳大利亞,中國,捷克共和國,丹麥,芬蘭,瑞典,瑞士,英國和美國 - 占據(jù)了十年。這項(xiàng)工作提供了超過39,000個(gè)大麥基因的知識。
自石器時(shí)代以來,酒精飲料一直是由麥芽制成的,有些人甚至認(rèn)為這是人類采用植物栽培的一個(gè)主要原因,至少在大麥被馴化的肥沃新月中。
在發(fā)芽過程中,淀粉酶蛋白由發(fā)芽種子產(chǎn)生,以分解儲存在干燥谷物中的富含能量的淀粉,產(chǎn)生單糖。然后這些糖可用于酵母發(fā)酵以產(chǎn)生醇?;蚪M序列顯示出比編碼淀粉酶的基因預(yù)期的更多變異性。
大麥種植在世界各地,俄羅斯,德國,法國,加拿大和西班牙是最大的生產(chǎn)國之一。在美國,大麥主要生長在西北部。愛達(dá)荷州,蒙大拿州和北達(dá)科他州是主
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