城市有個體微生物特征
根據(jù)一項新的研究,城市有自己獨特的微生物群落,但這些社區(qū)在同一城市的辦公室之間差異不大。這項工作于本周發(fā)表在美國微生物學(xué)會的開放獲取期刊mSystems上,可以深入了解建筑環(huán)境中微生物成分的驅(qū)動因素。這項研究由位于弗拉格斯塔夫北部亞利桑那大學(xué)的三個北美城市的辦公室進行的微生物采樣也發(fā)現(xiàn),人體皮膚對建筑環(huán)境表面的成分有很大影響,辦公室地板比其他表面有更多的微生物,可能是因為從工人的鞋子里堆積的土壤和其他材料。
“我們懷疑,在沒有極端條件如洪水的情況下,微生物可能被動地積聚在建筑環(huán)境中的表面而不是經(jīng)歷一個活躍的過程,”高級研究作者J. Gregory Caporaso博士說,他是生物科學(xué)和生物科學(xué)的助理教授。該大學(xué)微生物遺傳學(xué)和基因組學(xué)中心助理主任。“隨著我們繼續(xù)擴大對建筑環(huán)境微生物學(xué)的理解,可能包括對微生物群落的常規(guī)監(jiān)測,以追蹤可能影響人類健康的變化,我們的研究結(jié)果將有助于為未來的研究工作提供信息。”
為了了解微生物在建筑環(huán)境中如何在一段時間內(nèi)建立起來,Caporaso及其同事在以下每個城市監(jiān)測了三個辦公室:弗拉格斯塔夫,圣地亞哥和多倫多。在每個辦公室,他們安裝了三個采樣板,每個采樣板在地板,天花板和墻壁上; 每個板包含兩個或三個樣品,每個樣品都是涂漆的干墻,天花板和地毯,以及允許它們監(jiān)測環(huán)境參數(shù)的傳感器,包括樣品表面上的平衡相對濕度,可用光,占用率和溫度。在四個六周的采樣周期中收集樣品,每季一個。然后,他們使用稱為16S rRNA基因測序和ITS-1的實驗室技術(shù)來分析樣本中發(fā)現(xiàn)的細菌和真菌群落。
該團隊發(fā)現(xiàn),無論材料含有多少微生物而不是墻壁或天花板表面,地板樣品; 頻繁取樣的試驗板只能輕微破壞微生物群落; 并且城市有自己的標(biāo)志性微生物群落。“這特別有趣,因為即使在每個城市,我們研究的辦公室在規(guī)模,使用模式和通風(fēng)系統(tǒng)方面也各不相同,”Caporaso說,“這表明地理位置比推動這些特征更重要。在我們研究的范圍內(nèi)的辦公室的細菌群落組成。“
弗拉格斯塔夫辦事處的微生物群落比圣地亞哥或多倫多的微生物群落更為豐富,雖然卡波拉索說不清楚原因。
為了確定任何特定的辦公室工作人員或身體部位是否是辦公室中看到的微生物的來源,研究人員還從弗拉格斯塔夫辦事處的一名工作人員和執(zhí)行抽樣的個人那里收集了人類皮膚,鼻腔,口腔和糞便微生物組樣本。所有三個城市的技術(shù)。
在所有九個辦事處中,該團隊發(fā)現(xiàn)人類皮膚細菌群落是辦公室細菌群落樣本的最大可識別來源,其中至少25-30%的辦公室表面微生物群來自人體皮膚。人類鼻腔微生物組似乎也是辦公室表面微生物群落的一個小但一致的來源。然而,這些辦事處中最大的微生物群落來自非人類來源,如環(huán)境。
研究人員發(fā)現(xiàn),收集的辦公室微生物與室內(nèi)環(huán)境變量(如溫度或濕度)之間沒有顯著關(guān)聯(lián)。
該團隊接下來將模擬洪水事件,以檢查建筑環(huán)境中的真菌群落如何隨時間而變化。
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