來自哥本哈根大學(xué)，奧爾胡斯大學(xué)，奧爾胡斯大學(xué)醫(yī)院和Rigshospitalet等人的國際研究人員通過全基因組分析，對38種不同類型的癌癥中的突變進(jìn)行了定位。研究人員已經(jīng)編制了一份癌癥突變目錄，將在全球范圍內(nèi)提供給醫(yī)生和研究人員。

在全球范圍內(nèi)，癌癥是最大的殺手之一，2018年，估計(jì)有960萬人死于該疾病。為了提供對該疾病的最佳治療，必須找出導(dǎo)致癌癥的突變。

在一項(xiàng)名為“全基因組全癌基因分析”(PCAWG)的大型國際合作中，來自哥本哈根大學(xué)，奧爾胡斯大學(xué)，奧爾胡斯大學(xué)醫(yī)院和Rigshospitalet的研究人員幫助繪制了38種不同類型癌癥的突變圖。

突變都被合并到一個(gè)目錄中。該目錄已經(jīng)在線上提供，它使來自世界各地的醫(yī)生和研究人員可以查找有關(guān)疾病，進(jìn)行咨詢并查找有關(guān)特定患者癌癥的信息。

以前的大多數(shù)重大研究都集中在編碼占基因組2%的蛋白質(zhì)上。我們已經(jīng)研究和分析了整個(gè)基因組，并且我們對影響癌癥基因的突變進(jìn)行了分析，從而使我們能夠通過遺傳學(xué)方式解釋我們研究的95%的癌癥發(fā)生。”

Joachim Weischenfeldt，合著者，哥本哈根大學(xué)生物技術(shù)研究與創(chuàng)新中心副教授，Rigshospitalet的Finsen實(shí)驗(yàn)室

“因此，如果您知道哪些突變導(dǎo)致了癌癥，即所謂的驅(qū)動(dòng)程序突變，您將能夠更好地定制使用最合適藥物的治療方法或設(shè)計(jì)抗癌新藥。精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)完全依賴于每種癌癥中驅(qū)動(dòng)因子突變的定位以及診斷，預(yù)后和改善的治療方法，''合著者，奧爾胡斯大學(xué)和奧爾胡斯生物信息學(xué)研究中心及臨床醫(yī)學(xué)系教授Jakob Skou Pedersen說大學(xué)醫(yī)院。

新的研究結(jié)果發(fā)表在科學(xué)期刊《自然》的特刊上，重點(diǎn)是PCAWG。迄今為止，它是最大的原發(fā)癌全基因組研究。這意味著該分析是基于腫瘤起源的組織中的材料并且在患者接受任何治療之前進(jìn)行的。

研究人員主要分析并掌握了最常見癌癥的數(shù)據(jù)，例如肝癌，乳腺癌，胰腺癌和前列腺癌?？偣玻麄兎治隽藖碜?,600多名患者的全基因組測序腫瘤樣本。

根據(jù)他們的分析，他們可以看到癌癥類型中的突變數(shù)量相差很大。兒童的髓樣異常增生和癌癥幾乎沒有突變，而肺癌中可能多達(dá)100,000個(gè)突變。

但是，盡管突變的數(shù)量范圍很廣，研究人員可以發(fā)現(xiàn)，平均而言，總有4-5個(gè)突變正在驅(qū)動(dòng)該疾病，即所謂的驅(qū)動(dòng)因子-無論它是哪種癌癥。

令人驚訝的是，幾乎所有人都具有相同數(shù)量的驅(qū)動(dòng)程序突變。然而，與理論相一致的是，癌性腫瘤需要在事情開始出現(xiàn)問題之前改變細(xì)胞中的某些機(jī)制，” Jakob Skou Pedersen說。

在目錄中，研究人員將突變分為駕駛員和乘客。驅(qū)動(dòng)程序突變?yōu)榘┌Y提供了增長益處，而乘客突變涵蓋了所有其他突變并且無害。所有變異中的絕大多數(shù)是乘客。

遺傳學(xué)或組織

為了存儲和處理大量數(shù)據(jù)，研究團(tuán)隊(duì)使用了所謂的云計(jì)算，使用了分布在三大洲的13個(gè)數(shù)據(jù)中心。他們在歐洲，美國和亞洲設(shè)有中心。

建立大型數(shù)據(jù)集對于確定不同類型癌癥的共同點(diǎn)和獨(dú)特點(diǎn)是必不可少的。如今，癌癥是根據(jù)疾病的起源組織來劃分的，例如乳房，大腦和前列腺。

研究人員發(fā)現(xiàn)了許多對于每種類型的組織都是完全獨(dú)特的事物。相反，他們還發(fā)現(xiàn)了跨組織類型的許多共同特征。根據(jù)Joachim Weischenfeldt的說法，因此有必要重新考慮我們對癌癥的看法。

癌癥是一種遺傳性疾病，突變的類型通常比癌癥起源于人體更重要。這意味著我們不僅需要將癌癥視為一種組織特異性疾病，還要根據(jù)遺傳學(xué)和其突變來進(jìn)行研究。”

``例如，我們可能患有某種類型的乳腺癌和前列腺癌，其驅(qū)動(dòng)程序突變相似。這意味著前列腺癌患者可能會像乳腺癌患者一樣從相同的治療中受益，因?yàn)檫@兩種類型都有重要的驅(qū)動(dòng)突變，” Joachim Weischenfeldt說。