多組學(xué)方法提供了有關(guān)花生過(guò)敏嚴(yán)重程度的新見(jiàn)解
西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院的研究人員已經(jīng)確定了與花生過(guò)敏嚴(yán)重程度相關(guān)的新基因,以及這些基因在過(guò)敏反應(yīng)中與其他基因相互作用的方式。
該發(fā)現(xiàn)于12月12日發(fā)表在《變態(tài)反應(yīng)與臨床免疫學(xué)雜志》上,可能會(huì)導(dǎo)致對(duì)花生變態(tài)反應(yīng)的更好治療。
花生過(guò)敏的嚴(yán)重程度差異很大,是致命的與食物相關(guān)的過(guò)敏反應(yīng)的主要原因。用于確定是否存在花生過(guò)敏的測(cè)試無(wú)法提供任何有關(guān)攝入花生的人是否會(huì)出現(xiàn)輕度皮疹,嚴(yán)重腫脹或危及生命的問(wèn)題(如呼吸困難或心血管并發(fā)癥)的任何線索。
該研究的資深作者Supinda Bunyavanich醫(yī)學(xué)博士,醫(yī)學(xué)博士,遺傳學(xué)和基因組科學(xué)與兒科學(xué)副教授,西乃山埃利奧特和羅斯林·賈菲食品過(guò)敏研究所副所長(zhǎng),特別好奇為什么反應(yīng)的嚴(yán)重性如此變化。無(wú)論是作為臨床科學(xué)家還是對(duì)花生過(guò)敏的孩子的母親,都是如此。
為了幫助解決這個(gè)問(wèn)題,Bunyavanich博士和她的團(tuán)隊(duì)使用了新穎的多組學(xué)方法(對(duì)給定分子類型的系統(tǒng)范圍測(cè)量的作用,關(guān)系和作用進(jìn)行研究),以鑒定可能加劇了花生過(guò)敏反應(yīng)的嚴(yán)重性。這些方法包括轉(zhuǎn)錄組學(xué),跨基因組的基因表達(dá)研究和表觀基因組學(xué),影響基因表達(dá)的DNA可逆修飾研究。
該研究涉及21位7至17歲的花生過(guò)敏兒童,他們逐漸增加劑量的花生直至表現(xiàn)出過(guò)敏反應(yīng)??茖W(xué)家分三次從參與者身上抽血:進(jìn)食前,反應(yīng)時(shí)和反應(yīng)后。研究小組通過(guò)在另外19名兒童中重復(fù)這項(xiàng)研究,證實(shí)了他們最初的研究結(jié)果。
隨著孩子們的反應(yīng),該團(tuán)隊(duì)多次采集血樣可以分析轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組(可以告訴科學(xué)家哪些基因是通過(guò)稱為甲基化的過(guò)程打開(kāi)或關(guān)閉的)。使用這種全基因組方法,他們確定了300多個(gè)與反應(yīng)嚴(yán)重程度相關(guān)的基因和200個(gè)CpG位點(diǎn)(DNA可以通過(guò)甲基化被激活或失活的區(qū)域)。該團(tuán)隊(duì)使用整合網(wǎng)絡(luò)將這些數(shù)據(jù)結(jié)合在一起,還描述了基因表達(dá),CpG位點(diǎn)和反應(yīng)嚴(yán)重性之間的關(guān)鍵相互作用。
他們不僅確定了與花生過(guò)敏嚴(yán)重程度有關(guān)的新基因,而且還設(shè)法表征了這些基因在變態(tài)反應(yīng)過(guò)程中與其他基因和CpG位點(diǎn)相互作用的方式,以調(diào)節(jié)生物過(guò)程。該研究的主要作者,邦尼瓦維奇實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員Anh Do博士說(shuō):“ 應(yīng)用多組學(xué)方法揭示基因和甲基化位點(diǎn)如何相互作用以影響這些花生過(guò)敏性孩子的反應(yīng)嚴(yán)重程度,這非常令人興奮。” 。
在這些見(jiàn)解中,有一項(xiàng)發(fā)現(xiàn)是,盡管這些發(fā)現(xiàn)支持了變態(tài)反應(yīng)中適應(yīng)性免疫的公認(rèn)作用,但他們還表明,中性粒細(xì)胞(一種白細(xì)胞)介導(dǎo)的免疫在反應(yīng)嚴(yán)重性中起著重要作用。Bunyavanich博士說(shuō):“我們知道中性粒細(xì)胞介導(dǎo)的免疫是免疫反應(yīng)的一部分,這項(xiàng)研究表明它可能在花生過(guò)敏反應(yīng)的嚴(yán)重程度中起著核心作用。”
此外,研究小組確定的一種反應(yīng)嚴(yán)重程度驅(qū)動(dòng)因素之一,即ARG1基因,可被精氨酸酶抑制劑抑制,精氨酸酶抑制劑是一種正在研究中的多種疾病藥物。這項(xiàng)研究的發(fā)現(xiàn)表明,它也可能是治療花生過(guò)敏的潛在靶標(biāo)。
Bunyavanich博士希望未來(lái)的研究能夠識(shí)別出一些生物標(biāo)志物,這些標(biāo)志物可以預(yù)測(cè)誰(shuí)可能有嚴(yán)重的反應(yīng)而不必先將其暴露于花生。但與此同時(shí),她指出,這項(xiàng)研究“希望能從更大的角度挑戰(zhàn)人們思考食物過(guò)敏 ”。
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