埃博拉病毒編碼的microRNA樣片段可作為早期診斷的生物標(biāo)志物
在一項新的研究中,南京大學(xué)的張晨宇小組與軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院的陳澤亮小組合作,報道埃博拉病毒編碼的微小RNA樣片段可作為早期診斷的生物標(biāo)記。它發(fā)表在Cell Research上。
埃博拉病毒病(EVD)是由埃博拉病毒種引起的嚴(yán)重傳染病。EBOV導(dǎo)致2013-2015年西非流行,并導(dǎo)致至少24,000例可疑病例和10,000例確認(rèn)死亡。EVD的早期診斷不僅對于實施有效的干預(yù)措施至關(guān)重要,而且對于預(yù)防感染的傳播也至關(guān)重要。但是,在早期診斷EVD特別困難。埃博拉病毒引起的癥狀在許多其他感染中都可見,包括瘧疾,傷寒和流感,有些患者甚至患上了沒有特定體征和癥狀的疾病。診斷疑似埃博拉病毒感染的當(dāng)前方法包括逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng),抗原捕獲酶聯(lián)免疫吸附測定,免疫球蛋白M和免疫球蛋白G ELISA。
在先前的研究中,同一小組以及其他研究小組已經(jīng)證明,真核細胞和病毒產(chǎn)生的microRNA(miRNA)以高度穩(wěn)定,無細胞的形式存在于人血中,這些所謂的循環(huán)miRNA可以作為非侵入性生物標(biāo)志物用于早期診斷各種疾病,包括病毒性疾病。由于沒有足夠的可行方法來早期診斷EVD,Zhang嘗試通過推測可在人血中檢測到的EVDV特異性小非編碼RNA來取得突破。
據(jù)報道,一個令人欣喜的發(fā)現(xiàn)是,該小組利用真核生物中產(chǎn)生miRNA的原理推斷了由EVDV編碼的miRNA樣片段的推定序列。在細胞環(huán)境中,然后在克隆的pre-miR序列存在的情況下驗證了假定的miRNA樣片段的存在和成熟。在軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院的合作下,他們通過qRT-PCR,Northern印跡和TA克隆/測序進一步鑒定了EVD患者血清中的埃博拉病毒編碼的miRNA樣片段。令人驚訝的是,隨后的結(jié)果表明,這種miRNA樣片段在EVD幸存者的急性期存在,但在恢復(fù)期卻消失了。具有重大臨床意義的是,在病毒血癥發(fā)生之前,可檢測到的埃博拉基因組RNA可在EVD患者中檢測到該miRNA樣片段,
早期診斷對于埃博拉疫情的控制至關(guān)重要:
1)早期診斷增加了EVD患者的生存機會。據(jù)估計,社區(qū)中約60%的埃博拉感染仍未被診斷;雖然60-90%的未經(jīng)治療的埃博拉患者死亡,但支持性醫(yī)療可以將這一比率降低到30%以下。即使是設(shè)法到達醫(yī)院接受治療的患者中,大多數(shù)仍在入院后2天內(nèi)死亡,因為對于這些嚴(yán)重疾病而言,接受適當(dāng)治療已經(jīng)太遲了。
2)早期診斷有助于減少EBOV的擴散和有意釋放。據(jù)估計,每位埃博拉患者在沒有有效隔離的情況下都會將病毒傳播給另外1.8個人,導(dǎo)致感染呈指數(shù)增長。早期診斷和隔離可以將每個感染病例的傳播減少到一個人以下,從而將病毒傳播給其他人的可能性降到最低。在發(fā)達國家,完善的醫(yī)療系統(tǒng)可以迅速識別和隔離潛在患者;但是,在西非沒有及時采取有效的管理措施,導(dǎo)致了目前埃博拉疫情的大規(guī)模爆發(fā)。因此,在衛(wèi)生系統(tǒng)脆弱和資金不足的地區(qū),早期診斷對于控制流行病尤其重要。因此,當(dāng)前鑒定的miRNA樣片段可以用作EVD的早期生物標(biāo)記,以推進可診斷的窗口并減少分離和治療出現(xiàn)可疑癥狀的患者的困難。更重要的是,由于EBOV的miRNA樣片段高度保守,因此如果再次出現(xiàn)埃博拉病毒,它可以預(yù)測和預(yù)防埃博拉病毒爆發(fā)。
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