研究人員對(duì)莫哈韋沙漠烏龜?shù)男蛄谢蚪M
亞利桑那州立大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一組科學(xué)家對(duì)莫哈韋沙漠烏龜(Gopherus agassizii)的基因組進(jìn)行了測(cè)序,該物種是莫哈韋沙漠的一種長(zhǎng)壽物種。結(jié)果可以幫助動(dòng)物生存越來越多的威脅。
莫哈韋沙漠烏龜是大約三千五百萬年前在北美出現(xiàn)的六種沙漠烏龜之一,可以在加利福尼亞,內(nèi)華達(dá)州,猶他州和亞利桑那州找到。
也被稱為阿加西(Agassiz)的沙漠龜,該物種已受到棲息地喪失,呼吸道疾病和其他人為因素的嚴(yán)重影響。例如,在該物種的一個(gè)區(qū)域中,密度范圍從1979年的225個(gè)人/ km 2下降到1992年的約75個(gè)人/ km 2。
莫哈韋沙漠烏龜在美國(guó)《瀕危物種法》中被列為“受威脅”,并被國(guó)際自然保護(hù)聯(lián)盟(IUCN)視為“易受傷害”。
為了幫助保護(hù)該物種遺傳多樣性的保護(hù)工作,亞利桑那州立大學(xué)教授Kenro Kusumi和他的合著者生成了一個(gè)全基因組參考序列,并帶有基于成人骨骼肌,肺,腦和血液的深轉(zhuǎn)錄組序列的注釋。
亞利桑那州立大學(xué)的合著者馬克·托利斯博士說:“莫哈韋沙漠烏龜基因組是保護(hù)該物種的重要資源,特別是因?yàn)樵摲N群正遭受嚴(yán)重疾病的困擾。”
“研究人員尚未完全了解其原因或使烏龜易感的原因。”
“對(duì)該基因組進(jìn)行解碼將有助于我們對(duì)哪些烏龜基因進(jìn)行足夠迅速的進(jìn)化以幫助它們克服這一威脅進(jìn)行分類。”
研究人員獲得了特定烏龜標(biāo)本的遺傳數(shù)據(jù),組裝并注釋了基因組,并了解了烏龜?shù)倪M(jìn)化史。
Kusumi教授說:“從技術(shù)上來說,對(duì)基因組進(jìn)行解碼變得容易得多。”
“目前的挑戰(zhàn)是對(duì)烏龜基因組中的信息進(jìn)行解碼。我們可以利用與小鼠和人類基因組相似性的線索。”
“找到廣為人知的'大海撈針'將是確定指導(dǎo)針對(duì)傳染病的免疫反應(yīng)的基因,以及在莫哈韋沙漠惡劣條件下生存的能力。”
他補(bǔ)充說:“對(duì)我們來說,了解烏龜多樣性在其地理范圍內(nèi)的位置非常重要。”
“確定遺傳多樣性的熱點(diǎn)有助于從保護(hù)的角度管理物種,并保護(hù)烏龜種群,以便在未來幾年更好地應(yīng)對(duì)未知的挑戰(zhàn)。”
研究小組還分析了莫哈韋沙漠烏龜與其姐妹物種索諾蘭沙漠烏龜(Gopherus morafkai)的遺傳差異。
“我希望這項(xiàng)研究將使其他機(jī)構(gòu)能夠提出新的問題,如果沒有這項(xiàng)研究他們將無法提出這些問題,”合著者,亞利桑那州立大學(xué)的Greer Dolby博士說。
“例如,'烏龜必須與哪些免疫基因?qū)共≡w?他們的免疫系統(tǒng)如何在面臨許多威脅的環(huán)境中發(fā)揮作用?而且,不斷變化的環(huán)境將如何影響這一點(diǎn)?” 這些是管理物種時(shí)要回答的重要問題。現(xiàn)在,我們可以開始調(diào)查了。”
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