根據(jù)美國疾病控制和預(yù)防中心出版的9月出版的“ 新發(fā)傳染病”(Emerging Infectious Diseases)上發(fā)表的一項研究，老年癌癥患者發(fā)生艱難梭菌感染(CDI)的可能性增加。

來自紐約市Memorial Sloan Kettering癌癥中心的醫(yī)學(xué)博士Mini Kamboj及其同事進(jìn)行了一項回顧性隊列研究，采用巢式病例對照分析來檢查老年癌癥患者的CDI風(fēng)險。包括93,566名醫(yī)療保險受益人的數(shù)據(jù); 巢式病例對照分析包括2,421例CDI病例和12,105例匹配對照。

研究人員發(fā)現(xiàn)，在研究期間，93,566名醫(yī)療保險受益人中有2.6%患有CDI。在未經(jīng)調(diào)整的分析中，患者與非癌癥患者的比例為2.8%和2.4%。在巢式病例對照分析中，癌癥患者發(fā)生CDI的幾率升高(調(diào)整后的比值比為1.15)。與沒有癌癥診斷相比，液體腫瘤的潛在診斷與CDI風(fēng)險增加顯著相關(guān)(調(diào)整后的比值比為1.74)。對于患有實體瘤的患者，對于那些最近診斷出癌癥并且在診斷時具有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的患者，CDI發(fā)展的幾率升高。該研究結(jié)果與先前的醫(yī)療保健相關(guān)風(fēng)險無關(guān)。

作者寫道：“老年人CDI的負(fù)擔(dān)在患有潛在癌癥的人中更大。”正當(dāng)國際上對Zika簽約的恐懼在2017年開始消退時，一場未被發(fā)現(xiàn)的爆發(fā)在古巴達(dá)到頂峰 - 離邁阿密海岸僅300英里。Scripps Research的一個科學(xué)家小組與其他幾個組織合作，通過將空中旅行模式與來自受感染旅行者的病毒樣本的基因組測序重疊，揭示了隱藏的爆發(fā)。該發(fā)現(xiàn)在8月22日的Cell雜志的封面上有所體現(xiàn)。

“像寨卡這樣的傳染病是全球性的問題，而不是當(dāng)?shù)氐膯栴}，如果我們要保持領(lǐng)先于迫在眉睫的威脅，更多的國際合作和協(xié)調(diào)是至關(guān)重要的，”斯克里普斯研究副教授兼主任Kristian Andersen博士說。斯克里普斯研究轉(zhuǎn)化研究所的傳染病基因組學(xué)。“通過這項研究，我們開發(fā)了一個框架，用于更全面，更主動地了解病毒如何傳播。傳統(tǒng)上對本地測試的依賴可能并不總是足夠的。”

Scripps Research與耶魯大學(xué)，佛羅里達(dá)州墨西哥灣沿岸大學(xué)，佛羅里達(dá)州衛(wèi)生部以及許多其他組織合作開展此項目。

拼湊爆發(fā)

該研究指出，當(dāng)巴西在2015年春季發(fā)現(xiàn)蚊子傳播的寨卡病毒時，它已經(jīng)流傳了至少一年，進(jìn)入了40多個國家。很快，寨卡從一種鮮為人知的病毒上升到國際恐慌的源頭 - 由于在懷孕期間感染寨卡的婦女所生的嬰兒有時可能導(dǎo)致小頭畸形，這一事實加劇了人們的擔(dān)憂。

對寨卡的協(xié)調(diào)反應(yīng)依賴于各國準(zhǔn)確檢測病例并向國際衛(wèi)生機(jī)構(gòu)報告。截至2016年底，這些衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)表明該疫情已接近尾聲。隨后，該病毒從旅行者的視線中消失，世界衛(wèi)生組織結(jié)束了將寨卡稱為“國際關(guān)注的突發(fā)公共衛(wèi)生事件”。

然而，安徒生和他的合作者發(fā)現(xiàn)，當(dāng)時未經(jīng)檢測到的疫情在古巴達(dá)到頂峰，不受國際衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的關(guān)注。令人驚訝的是，這項研究表明，疫情在一年之后落后于其他加勒比海國家，這可能是由于一場激進(jìn)的蚊子控制運動推遲了疾病的出現(xiàn)。研究人員指出，古巴埃及伊蚊(包括登革熱)傳播的其他傳染病也同時在古巴缺席。

安德森的團(tuán)隊在2017年開始調(diào)查與旅行相關(guān)的寨卡病例時，不知道它會暴露一次未知的爆發(fā)?？茖W(xué)家們只是想知道這種流行病是否真的在逐漸消退。相反，他們發(fā)現(xiàn)來自加勒比海的穩(wěn)定數(shù)量的旅行者仍在感染這種病毒。由于無法獲得可靠的當(dāng)?shù)夭±龍蟾妫撔〗M設(shè)計了一種方法，通過從訪問過古巴的受感染旅行者那里獲取血樣，然后使用基因組測序重建病毒血統(tǒng)和爆發(fā)動態(tài)來估計當(dāng)?shù)鼗疾÷省Ｔ摲椒ū环Q為“基因組流行病學(xué)”。

安德森實驗室的Scripps Research研究生，該研究的三位共同作者之一Karthik Gangavarapu說，來自美洲流行病的所有寨卡病毒都來自一個祖先，這讓該團(tuán)隊創(chuàng)建了一個“家庭”樹“并追蹤病毒的根源。

通過檢查每個病毒樣本中的微小基因組變化，Gangavarapu能夠確定“時鐘速率”以揭示病毒的年齡。時間表確定古巴的疫情比加勒比地區(qū)的其他疫情晚一年確定。“我們意識到整個爆發(fā)都未被發(fā)現(xiàn)，”Gangavarapu說。

另一個主要的數(shù)據(jù)來源是旅行監(jiān)控。Sharada Saraf是Andersen實驗室的本科實習(xí)生，也是該研究的共同第一作者，他分析了航空公司的旅行時間表，飛行模式和游輪目的地。這些信息共同描繪了在有關(guān)時期內(nèi)有多少人訪問了古巴和其他寨卡流行國家。

“鑒于未檢測到的病毒爆發(fā)有可能在全球蔓延，我希望這項研究將鼓勵利用旅行監(jiān)測和基因組數(shù)據(jù) - 除了本地報告 - 以便進(jìn)行未來的監(jiān)測工作，”Saraf說。

Saraf還從多個來源獲取健康數(shù)據(jù)并將其解析出來進(jìn)行分析。“這些數(shù)據(jù)是公開的，但通常無法用于分析格式，”她說。“例如，數(shù)據(jù)可能以條形圖形式顯示，需要大量時間來提取我們可以分析的實際數(shù)字。這項工作的一個好處是我們已經(jīng)將這些數(shù)據(jù)整合到一個易于下載的數(shù)據(jù)中和可用的格式，并在我們的實驗室網(wǎng)站上公布，供任何人在生成后立即使用。“

同樣，該實驗室立即提供了其寨卡病毒序列數(shù)據(jù)，突出了一個新的框架，用于在突發(fā)公共衛(wèi)生事件期間如何公開共享數(shù)據(jù)，Saraf說。

預(yù)防下一次爆發(fā)

安德森的團(tuán)隊指出，目前仍不清楚寨卡傳播是否正在進(jìn)行，因為當(dāng)?shù)貓蟮赖牟町惱^續(xù)阻礙檢測。安德森說，雖然使用旅行者作為哨兵可以揭示爆發(fā)，但就像在這種情況下那樣，更加豐富的公共數(shù)據(jù)是必要的，以超越威脅。

他說，公共衛(wèi)生組織和學(xué)術(shù)實驗室必須加強(qiáng)信息共享實踐。這一點，以及更好的檢測技術(shù)和改進(jìn)的政府資金，用于蚊子監(jiān)測等活動可以幫助避免未來的爆發(fā)。

“許多嚴(yán)重的疾病 - 不僅僅是寨卡病毒 - 幾乎與蚊子種群的波動完全相關(guān)，但這種類型的數(shù)據(jù)并未在世界上大多數(shù)地方被收集或提供，”安德森說。“特別是當(dāng)蚊子種群和其他傳染病動物宿主因氣候變化和人口不斷增加而增加時，政府優(yōu)先考慮這種主動監(jiān)測正變得至關(guān)重要。”

Gangavarapu指出，該團(tuán)隊將旅行監(jiān)測與基因組流行病學(xué)相結(jié)合的方法的影響遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了這項研究：“它可以應(yīng)用于許多可能無法檢測疾病或可能有報告偏見的國家。” “這些發(fā)現(xiàn)可用于指導(dǎo)CDI預(yù)防策略。”