在土壤病研究中成功地證明了新技術(shù)和新技術(shù)
猝死綜合癥(SDS)是一種突出的大豆性土傳病,可能具有破壞性。SDS產(chǎn)量損失可達100%,具體取決于受影響的大豆品種和出現(xiàn)癥狀時的發(fā)育階段。
由于發(fā)生率的增加,SDS近年來已經(jīng)進行了大量研究,土壤剖析是研究這種真菌病的主要工具。迄今為止,幾乎所有土壤剖面都涉及在SDS存在的地方識別土壤的物理和化學(xué)特征。
在一篇新的Phytobiomes期刊文章中,題為“揭示影響大豆猝死綜合癥發(fā)展的微生物和土壤因子”,Srour,et al。向科學(xué)界展示一種分析土壤的新方法,以確定SDS的發(fā)生率和嚴(yán)重程度:不僅分析土壤的物理和化學(xué)特性,而且分析土壤的微生物。
“田間SDS的發(fā)生取決于物理和生物因素,土壤對疾病的抑制是一個眾所周知的現(xiàn)象,”南伊利諾伊大學(xué)副教授,該文章的通訊作者Ahmad Fakhoury博士說。“促進和維持土壤對疾病的天然抑制作用可能是土壤病原體有效,可持續(xù)管理的必要條件。”
在這項研究中,研究人員分析了伊利諾伊州,愛荷華州和明尼蘇達州45個大豆田的土壤樣本。從田間的癥狀性斑塊以及未發(fā)生SDS葉片癥狀的鄰近區(qū)域收集樣品。
然后在該研究中使用新的工具和技術(shù)來檢測“患病”和“健康”土壤中的微生物群體,并將它們的存在與SDS的發(fā)生率和嚴(yán)重性相關(guān)聯(lián)。
通過這些樣本,Srour等人。研究了土壤微生物群落的作用,以及土壤樣品的物理和化學(xué)性質(zhì)與SDS發(fā)展的關(guān)系。他們測量了多種與土壤相關(guān)的因子,并使用特異于細(xì)菌,真菌,古細(xì)菌,卵菌和線蟲的標(biāo)記以及測序,以確定可能與SDS發(fā)育相關(guān)的關(guān)鍵類群。
通過這些方法,他們生成了14,200,000個序列,并將其映射到國家生物技術(shù)信息中心的核苷酸數(shù)據(jù)庫,并使用幾種生物信息學(xué)工具進行分類比較。
這種獨特的分析方法發(fā)現(xiàn),健康和病害區(qū)域之間的細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)存在顯著差異,這表明土壤中多種微生物類群的相對豐度是SDS發(fā)生率的關(guān)鍵決定因素。
“本文介紹的工作記錄了首次嘗試使用宏基因工具評估生物因子在確定大豆猝死綜合癥(SDS)發(fā)病率方面的重要性,”Fakhoury說。“這基本上是解決影響這種疾病發(fā)生的生物相互作用的復(fù)雜性的第一次嘗試。”
Fakhoury說他們的新方法和研究技術(shù)在其他幾個方面很重要:
這些技術(shù)可用于指示土壤的“健康”及其維持Fusarium v??irguliforme的能力,F(xiàn)usarium v??irguliforme是導(dǎo)致SDS的主要真菌病原體。
其他人可以在此研究的基礎(chǔ)上進一步表征影響F. virguliforme的物種的作用并研究它們相互作用的生物學(xué)。
類似的技術(shù)可用于研究其他土壤病原體和疾病,以尋求其有效和可持續(xù)的管理。
“我們使用的新興工具和技術(shù)可以區(qū)分復(fù)雜的微生物相互作用,”Fakhoury說。“這最終將使我們能夠設(shè)計和采用更有效和可持續(xù)的戰(zhàn)略來管理SDS和其他對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)有害的疾病。”
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