酸性補(bǔ)丁調(diào)節(jié)對遺傳信息的獲取
染色質(zhì)重塑 - 蛋白質(zhì)機(jī)器,包裝和解包染色質(zhì),細(xì)胞核中緊密纏繞的DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物 - 是關(guān)鍵細(xì)胞過程的重要和強(qiáng)大的調(diào)節(jié)劑,如復(fù)制,重組和基因轉(zhuǎn)錄和抑制。在8月2日發(fā)表在“自然”雜志上的一項(xiàng)新研究中,由普林斯頓大學(xué)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的研究小組詳細(xì)介紹了一類ATP依賴性染色質(zhì)重塑器(稱為ISWI)如何調(diào)節(jié)遺傳信息的獲取。
研究人員報(bào)告說,ISWI改造者使用核小體的結(jié)構(gòu)特征,稱為“酸性斑塊”來重塑染色質(zhì)。核小體是染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)亞基,并且經(jīng)常與纏繞在線軸上的線相比較。
“酸性斑塊是一個(gè)帶負(fù)電的表面,呈現(xiàn)在核小體盤的每個(gè)面上,由兩種不同的組蛋白H2A和H2B貢獻(xiàn)的氨基酸形成,”分子生物學(xué)系研究生Geoffrey Dann說。普林斯頓大學(xué)和該研究的主要作者。“組蛋白總體上非常帶正電荷,這使得核小體的帶負(fù)電荷的酸性斑塊非常獨(dú)特。酸性斑塊的識別從未涉及染色質(zhì)重塑。”
該研究在Tom Muir的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行,Van Zandt Williams Jr. 1965年化學(xué)教授和化學(xué)系主任。Muir小組的研究主要集中在闡明生物醫(yī)學(xué)相關(guān)系統(tǒng)中蛋白質(zhì)功能的生理化學(xué)基礎(chǔ)。
由于已知ISWI重塑器與核小體廣泛相互作用,研究人員假設(shè)信號以嵌入核小體內(nèi)的組蛋白的化學(xué)修飾形式傳遞給核小體起作用的重塑器。使用高通量篩選技術(shù),經(jīng)常用于藥物發(fā)現(xiàn)的分析過程使研究人員能夠快速進(jìn)行數(shù)萬次生化測量,以測試他們的假設(shè)。“已知存在于體內(nèi)的染色質(zhì)修飾數(shù)量是天文數(shù)字,”Dann說。
不僅實(shí)驗(yàn)表明ISWI改造者使用“酸性斑塊”來重塑染色質(zhì),而且還確定ISWI改造者家族之外的重塑酶也使用這種結(jié)構(gòu)特征,“這表明該特征可能是染色質(zhì)重塑的一般要求。發(fā)生,“丹恩說。某些作用于組蛋白的化學(xué)修飾他解釋說,與酸性斑塊相鄰的物質(zhì)也具有增強(qiáng)或抑制ISWI重塑活性的能力。“已知少數(shù)其他蛋白質(zhì)與染色質(zhì)相互作用也與酸性斑塊結(jié)合,我們還發(fā)現(xiàn)其中幾種蛋白質(zhì)的生物化學(xué)受這些修飾的影響。有趣的是,每種被測試的蛋白質(zhì)都有其自身的特征反應(yīng)。這一系列修改。“
高通量篩選技術(shù)方法還產(chǎn)生了龐大的數(shù)據(jù)庫,以推動未來研究的設(shè)計(jì),旨在進(jìn)一步了解ISWI監(jiān)管。“這項(xiàng)研究產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù),指向許多其他新的調(diào)控輸入,以染色質(zhì)修飾的形式,進(jìn)入ISWI重塑活動,”Dann說。“我們實(shí)驗(yàn)室的一個(gè)長期目標(biāo)是利用這一數(shù)據(jù)資源作為其他研究的啟動平臺,研究染色質(zhì)修飾如何影響ISWI重塑,以及它如何影響ISWI改造者在細(xì)胞中所承擔(dān)的各種角色。”
他們的研究結(jié)果還可能確定細(xì)胞染色質(zhì)重塑工具的分子庫中的新工具,以及對潛在癌癥治療靶點(diǎn)的研究。“已知酸性斑塊中的突變發(fā)生在某些類型的人類癌癥中,這突顯了酸性斑塊在染色質(zhì)生物學(xué)中的重要性,”Dann說。
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