新的“電影”技術(shù)以更清晰的分辨率顯示細(xì)菌信號(hào)

在新研究之后，細(xì)菌用于適應(yīng)環(huán)境的復(fù)雜信號(hào)網(wǎng)絡(luò)變得更加清晰。約翰英納斯中心的研究人員利用對(duì)植物生長促進(jìn)細(xì)菌熒光假單胞菌的研究開發(fā)了一種先進(jìn)的分析方法，他們希望這種方法能夠提高我們了解植物和人類疾病的能力。

直到最近，對(duì)細(xì)菌信號(hào)傳導(dǎo)的研究傾向于孤立地研究基因調(diào)控的不同方面。在這些個(gè)體方法的基礎(chǔ)上，John Innes團(tuán)隊(duì)使用一系列實(shí)驗(yàn)室，計(jì)算和數(shù)學(xué)技術(shù)來整合從多個(gè)不同微生物實(shí)驗(yàn)中獲得的數(shù)據(jù)。

這種方法使他們能夠?yàn)殛P(guān)鍵的細(xì)菌蛋白Hfq建立一個(gè)全面的“信號(hào)圖”，該蛋白可以控制許多臨床和農(nóng)業(yè)上重要的物種的毒力和應(yīng)激反應(yīng)。

與該項(xiàng)工作相關(guān)的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人Jacob Malone博士解釋說：“我們的技術(shù)使我們能夠跟蹤細(xì)菌細(xì)胞中的每個(gè)基因和蛋白質(zhì)，并根據(jù)給定的信號(hào)輸入說明它如何變化以及變化發(fā)生的程度。

“我們使用與之前研究相同的數(shù)據(jù)集，但我們開發(fā)了一種使用數(shù)學(xué)和編程整合數(shù)據(jù)的方法。如果你考慮電影的各個(gè)元素：攝影，配樂和劇本;通過組合它們你得到整部電影 - 比部分之和更大的東西。這是相同的原則，只有遺傳。“

該團(tuán)隊(duì)的研究結(jié)果發(fā)表在微生物學(xué)前沿(分析Hfq的復(fù)雜監(jiān)管環(huán)境 - 綜合，多組學(xué)方法，Grenga，L。等人2017)，有望改變我們調(diào)查細(xì)菌信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的方式，并將推進(jìn)我們的研究了解細(xì)菌如何與環(huán)境相互作用并調(diào)節(jié)感染。

“人們之前已經(jīng)在多個(gè)層面上查看了數(shù)據(jù)，但并未達(dá)到這一深度。”馬龍博士說。“最終，我們希望人們考慮以這種方式定期處理數(shù)據(jù)，”。

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