掠奪性細菌-尋求新一類抗生素
2016年,世界衛(wèi)生組織將抗生素耐藥性稱為“當今全球健康,糧食安全和發(fā)展面臨的最大威脅之一”。該公告列舉了越來越多的感染,例如結核病和淋病,由于對目前抗生素治療的抵抗力增加,每年治療變得越來越困難。然而抗生素是必不可少的 - 沒有它們,人類就會受到持續(xù)感染的困擾。那么,什么是確保持續(xù)治療的解決方案,同時解決阻力上升的驚人增長?
一種潛在的解決方案在于一種獨特的捕食性細菌,它以其他細菌為食,例如引起疾病的細菌。這組肉食動物被稱為“活抗生素”,引起了研究人員的關注,包括沖繩科學技術研究生院(OIST)的研究人員。在最近發(fā)表的一篇關于ACS合成生物學的論文中,OIST的研究人員已經(jīng)邁出了對一種如此微小的食人族B. bacteriovorus進行遺傳操作的第一步。他們已經(jīng)確定了可以允許操縱影響這種細菌掠奪行為的基因的工具。
“在未來,我們希望控制細菌的捕食 - 捕食的時間和程度,”核酸化學和工程部門的Mohammed Dwidar博士和該論文的第一作者解釋說。“[目前]我們?nèi)狈镜墓こ坦ぞ邅韺崿F(xiàn)這一目標。”
B. bacteriovorus對人類無害,但對其獵物 - 革蘭氏陰性細菌是致命的 - 其中包括大腸桿菌,沙門氏菌,軍團菌等壞人。因此,能夠控制它可能會治療許多不同類型的感染。然而,由于其不尋常的捕食性和其他獨特的特征,B. bacteriovorus的遺傳操作受到限制。
OIST研究人員使用核糖開關,這是已知在其他細菌中發(fā)揮良好作用的基因表達控制工具,以應對理解和操縱B. bacteriovorus捕食的挑戰(zhàn)。表達基因的方式遵循特定途徑 - 通過轉錄將DNA轉化為RNA,通過翻譯將RNA轉化為蛋白質(zhì),然后蛋白質(zhì)執(zhí)行不同的功能。核糖開關在翻譯階段進入。通過在RNA鏈的開頭放置核糖開關,然后用化學物質(zhì)“激活”它,核糖開關可以啟動或阻止RNA被翻譯成蛋白質(zhì)。
對于他們的研究,OIST研究人員將核糖開關插入到被認為對B. bacteriovorus的捕食行為很重要的基因之一:鞭毛σ因子fliA。然后他們用化學茶堿激活它。將經(jīng)過修飾的細菌與一些美味的大腸桿菌獵物一起放入培養(yǎng)皿中后,改良的B. bacteriovorus在茶堿存在下似乎比不存在時更快繁殖。這種快速增殖意味著B. bacteriovorus消耗其獵物的速度更快,因此繁殖速度更快。這反過來表明,茶堿可以控制捕食性生命周期。
除了“活性抗生素”最終目標之外,還有更多可能易于操作的B. bacteriovorus細胞的潛在用途。“人們希望有機食品不含化學物質(zhì),”Dwidar博士解釋說。“對于一些植物病害,捕食性細菌可能是抗菌劑的潛在安全替代品。我們也可以將它用于工業(yè),例如水處理廠。”
“未來,你可以將這些細菌噴灑在新鮮食物上,以防止食物中毒,”參與研究的Yohei Yokobayashi教授補充說。
有了OIST研究人員的研究成果,下一步就是要了解更多關于B. bacteriovorus以及可能能夠控制其行為的工具,以便有一天能夠實現(xiàn)其完全的抗生素潛力。
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