研究人員表明核小體可以抑制CRISPR-Cas9的切割效率
猶他大學(xué)的一組研究人員發(fā)現(xiàn)核小體可以抑制CRISPR / Cas9的切割效率。在他們發(fā)表在“美國國家科學(xué)院院刊”上的論文中,該小組描述了對酵母樣本的基因編輯技術(shù)及其發(fā)現(xiàn)的測試。
基因編輯技術(shù)CRISPR-Cas 9使用指導(dǎo)RNA來尋找和剪切DNA片段 - 但當(dāng)目標(biāo)片段是核小體的一部分時會發(fā)生什么?先前的研究表明,在這種情況下,切割效率可能會受到影響。在這項新的研究中,研究人員對此類實例進行了體內(nèi)試驗,發(fā)現(xiàn)先前的研究結(jié)果是正確的 - 在核小體上使用CRISPR-Cas 9可能效果不佳。
DNA鏈很小,但如果伸展的話,真的很長 - 大約6英尺長。因此,細胞具有將DNA包裝到細胞核中的機制。該機制涉及將鏈轉(zhuǎn)變成圍繞給定蛋白質(zhì)的束。這種卷起的束稱為核小體。邏輯表明,由于可訪問性問題,編輯DNA鏈的技術(shù)可能會遇到困難。其他研究人員已經(jīng)考慮過這種問題的可能性,但他們已經(jīng)在試管中對它們進行了研究,或者對已知不屬于核小體的鏈進行了研究。在這項新的研究中,研究人員試圖一勞永逸地找出CRISPR-Cas9的編輯鏈?zhǔn)欠衽c生物組織核小體的一部分一樣好,就像它在非生物組織中一樣。
該工作涉及使用活酵母中的不同指導(dǎo)RNA編輯CRISPR-Cas9基因,其允許編輯不同的靶標(biāo)。一些靶標(biāo)在核小體中,而另一些則不在。
研究人員報告說,核小體的切割效率遠低于非核小體區(qū)域的切割效率。但他們也找到了別的東西 - 當(dāng)用同樣的方法測試稱為鋅指的基因編輯技術(shù)時,他們發(fā)現(xiàn)沒有這樣的差異。該小組建議,在未來,基因編輯工作應(yīng)從核小體位置圖開始,以提高效率。
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