新技術(shù)有望提供更準確的基因組
阿德萊德大學的研究人員開發(fā)出一種新技術(shù),通過確定來自每個父母的基因組的確切部分,有助于更準確地重建人類基因組。今天發(fā)表在Nature Biotechnology雜志上的這項新技術(shù)還將使研究人員能夠識別任何類型基因組中的復雜性 - 從植物到動物 - 并提供比現(xiàn)有更精確的參考基因組。
基因組裝配計算重建基因組 - 細胞或生物體中存在的一整套基因或遺傳物質(zhì) - 來自測序機器可以讀取的更小的DNA片段,就像拼湊拼圖的片段一樣。
“我們與來自美國國家人類基因組研究所和美國農(nóng)業(yè)部的同事一起,從單個雜交個體中獲得了完整的婆羅門和安格斯牛基因組序列,”戴維斯研究主任約翰威廉斯教授說。阿德萊德大學羅斯沃西校區(qū)動物與獸醫(yī)學院中心。
幾千年前婆羅門和安格斯牛的亞種分別被馴化,并且從那時起經(jīng)歷了截然不同的選擇壓力:在婆羅門牛和安格斯牛的牛肉生產(chǎn)中的害蟲和干旱環(huán)境。這些不同的特征和歷史反映在它們的基因組中,這使它們成為理想的測試對象。
“每個人都擁有每個染色體的兩個拷貝。以前的技術(shù)已經(jīng)產(chǎn)生了基因組序列,甚至人類基因組序列,它們是每個染色體對混合在一起的混合體,并不能準確地捕獲基因組的實際序列,”Stefan Hiendleder教授說。來自阿德萊德大學動物與獸醫(yī)學院和該論文的共同作者。
“這種稱為三重分組的新技術(shù)首次為個體中每條染色體提供了真正的基因組序列,以及迄今為止可用的兩種牛亞種的最高質(zhì)量基因組,”Hiendleder教授說。
Trio binning利用最新一代的測序技術(shù),可以“讀取”更長的基因組區(qū)域 - 一次多達20,000個堿基或更多 - 與之前技術(shù)中的幾百個堿基相比。首先使用高精度短讀取對親本的基因組進行測序,以確定其基因組的哪些部分對于每個親本是獨特的。然后使用更長的讀數(shù)對后代的基因組進行測序。然后使用來自父母的較短序列的信息對這些讀數(shù)進行分類,從哪個父母繼承它們。
“Trio binning完全改變了以前的技術(shù),因為它使用了一種物種中最常見的基因組之間的雜交,”威廉姆斯教授說。
“到目前為止,基因組序列是由遺傳多樣性最小的個體構(gòu)建的。它標志著技術(shù)能力的顯著進步,對研究和醫(yī)學應(yīng)用具有廣泛的影響。
“Trio binning將有助于建立更準確的人類基因組變異記錄,這將提高基因測試的準確性,并有助于實現(xiàn)人們臨床護理中獨特DNA序列的目標,”威廉姆斯教授說。
推薦內(nèi)容
-
胃腸道疾病涉及腦到腸和腸到腦的途徑
最新研究表明,在腸易激綜合征(IBS)或消化不良的患者中,有一條獨特的腦-腸途徑(其中心理癥狀首先開始),以及一條獨特的腸-腦途徑(腸道癥狀
-
2021年上海養(yǎng)老金上調(diào)情況最新消息 今年上海市養(yǎng)老金調(diào)整方案
哈啰大家好,我是搬磚工,今天為大家?guī)戆哉几鱾€熱搜的頭條新聞。上海養(yǎng)老金調(diào)整一事,下面一起來瞧瞧吧!養(yǎng)老金調(diào)整最新消息公布,數(shù)據(jù)顯
-
伊朗一核科學家遭機槍掃射暗殺 車內(nèi)恐怖一幕曝光令人痛心
近日,在伊朗發(fā)生一起聳人聽聞的事情,據(jù)悉在當?shù)貢r間27日下午,伊朗一名頂尖核科學家在車內(nèi)遭機槍掃射暗殺,車內(nèi)恐怖一幕曝光令人痛心...
-
萬茜和老公徐洪濤是怎么認識的哪里人?萬茜個人資料簡介及老公照
說起萬茜,想必大家都知道她于1982年5月14日出生于湖南省益陽市,中國內(nèi)地影視女演員、歌手,畢業(yè)于上海戲劇學院表演系本科。2002年,出演
-
研究表明 食用黑巧克力可以改善視力
得克薩斯州圣安東尼奧市化身大學羅森堡分校驗光學校的一項新研究表明,食用黑巧克力可以提高看到低對比度和高對比度目標的能力,這可能...
-
12.25昆明呈貢區(qū)疫情最新信息公布 云南全省昨日新增確診病例6例
云南新增境外輸入確診病例2例,新增本土確診病例4例,系呈貢區(qū)主動就醫(yī)人員及其密切接觸者檢測發(fā)現(xiàn)。據(jù)消息顯示,12月24日0-24時,全省新增
-
2020九月最后一天心情語錄說說 九月再見十月你好朋友圈文案大全
今天是九月的最后一天,大步邁向十月的時候就不要回頭,過去的已經(jīng)過去,新的征程已經(jīng)開始。愿你在十月收獲不一樣的自己。下面我們一起...
-
8月12日湖南張家界疫情最新數(shù)據(jù)公布 張家界昨日新增本土確診7例
想必大家都知道,張家界,原名大庸市,湖南省地級市。轄2個市轄區(qū)(永定區(qū)、武陵源區(qū))、2個縣(慈利縣、桑植縣)。位于湖南西北部,澧水中上游
-
10月18日上海西安疫情最新實時消息公布 一旅行團一行7人核酸
【提醒】疫情還未結(jié)束,出門在外,還是要佩戴口罩。雖然疫情風險較低,但也不能掉以輕心,以免因為疏忽導致疫情防控出現(xiàn)漏洞,到時候會...
-
麗江反殺案怎么引起的真相是什么細節(jié)詳情 云南麗江反殺案件的
麗江反殺案唐雪獲國家賠償18萬元被羈押324天后被認定正當防衛(wèi)。那么,對于麗江反殺案的這個話題,今天的你是否也在關(guān)注著?具體什么情況?下