延時顯微鏡有助于揭示鏈霉菌生命周期中的制動機(jī)制
細(xì)菌用來抵御競爭對手的這些抗生素的生產(chǎn) - 作為復(fù)雜生命周期的一部分進(jìn)行協(xié)調(diào),這種生命周期以孢子的形成結(jié)束。在孢子形成的繁殖過程中,細(xì)菌進(jìn)入休眠狀態(tài),提高它們在不利條件下的存活率。如果研究人員能夠理解如何控制這種生殖生命周期,他們可能能夠利用臨床上有用的抗生素的生產(chǎn)。
在今天發(fā)表在美國微生物學(xué)會期刊mBio上的一項研究中,John Innes中心的研究人員發(fā)現(xiàn),一種關(guān)鍵蛋白質(zhì)可以起到“制動”的作用,以確保鏈霉菌孢子形成的正確時間。這種蛋白質(zhì)是一種叫做BldC的DNA結(jié)合蛋白。
研究小組表示,當(dāng)他們通過去除編碼蛋白質(zhì)的基因來移除制動器時,孢子形成發(fā)生得太早。為了解這種BldC制動器是如何工作的,該團(tuán)隊使用了一種稱為染色質(zhì) - 免疫沉淀 - 測序(ChIP-seq)的方法。該技術(shù)允許研究人員使用特異性抗體來鑒定BldC蛋白在鏈霉菌染色體上的結(jié)合位置。另一項稱為RNA測序(RNA-seq)的技術(shù)使他們能夠看到BldC蛋白打開或關(guān)閉哪些基因。
“這種方法表明BldC制動器的作用是通過在鏈霉菌非生殖性生長的時候保持孢子形成所需的重要基因,”第一作者M(jìn)att Bush博士解釋說。“令我們驚訝的是,這些研究表明,除了切換一些基因外,BldC還可以切換其他基因。因?yàn)锽ldC在染色體上的許多位置結(jié)合,一種可能性是它也用于組織染色體的結(jié)構(gòu) - 它是一種類核相關(guān)蛋白。)“
在未來的研究中還有待回答的一個問題是:如何去除BldC-“制動器”?
該研究使用了模式生物,委內(nèi)瑞拉鏈霉菌(Streptomyces venezuelae)(“Sven”)。S.委內(nèi)瑞拉的主要優(yōu)點(diǎn)是,與其他模式物種不同,它在液體和固體瓊脂平板上形成孢子。“這意味著我們可以使用延時熒光顯微鏡來實(shí)現(xiàn)鏈霉菌的電影實(shí)時進(jìn)行孢子到孢子的整個生命周期。我們可以在細(xì)胞中的蛋白質(zhì)上放一個熒光”標(biāo)簽“,看看它在哪里在這里,我們在產(chǎn)生孢子的細(xì)胞分裂事件所需的“FtsZ”蛋白上加上一個標(biāo)簽。布什博士說。
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