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      比較分析強調(diào)了以前育種計劃對木薯基因組的影響
      
			
      
				2019-01-24 11:14:53
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      對于全世界近10億人來說，木薯是主要作物，也是卡路里的主要來源。該植物易于栽培 - 插條在邊緣土地上生長良好 - 并且它非常耐受干旱。對于美國能源部而言，這些特性及其淀粉質(zhì)量使木薯成為生物燃料生產(chǎn)的潛在原料。
      

      比較分析強調(diào)了以前育種計劃對木薯基因組的影響
      

      雖然木薯易于栽培，但它特別容易受到植物病原體的侵害，這會嚴(yán)重降低作物產(chǎn)量。為了幫助改善這種根莖作物的育種策略，由加州大學(xué)伯克利分校的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的團隊，包括美國能源部聯(lián)合基因組研究所(JGI)，美國能源部科學(xué)用戶設(shè)施辦公室的研究人員，在4月份描述了木薯的遺傳多樣性。 18,2016高級在線出版“ 自然生物技術(shù) ”雜志。由于木薯根含有20-40%的淀粉，每公頃產(chǎn)量比玉米淀粉低15-30%，在世界許多地方，特別是非洲和東南亞，它代表了可再生能源的生物質(zhì)的戰(zhàn)略來源。正在生產(chǎn)用于運輸燃料的乙醇。在基因組學(xué)的幫助下，研究人員希望應(yīng)用先進(jìn)的育種策略，以提高木薯對疾病的抵抗力，提高作物產(chǎn)量。
      

      在DOE JGI社區(qū)科學(xué)計劃和羅氏454生命科學(xué)的支持下對木薯基因組進(jìn)行測序。自從草案序列于2009年發(fā)布以來，研究人員已經(jīng)使用額外的數(shù)據(jù)對其進(jìn)行了改進(jìn)，以便開發(fā)染色體標(biāo)度序列，部分是為了將信息應(yīng)用于改進(jìn)的育種策略。
      

      在該論文中，包括加州大學(xué)伯克利分校博士后研究員Jessen Bredeson和Jessica Lyons以及DOE JGI的Simon Prochnik和Albert Wu的團隊將木薯參考基因組與親蓖麻(Ricinis communis)，橡膠樹(Hevea brasiliensis)的基因組進(jìn)行了比較。 ，塞阿拉橡膠(Manihot glaziovii)，以及53種栽培和野生型木薯品種來自世界各地的。他們發(fā)現(xiàn)，非洲當(dāng)前育種工作中使用的木薯的遺傳多樣性已大大減少，其中木薯花葉病和木薯褐條病等病毒影響了許多國家的作物產(chǎn)量。他們能夠檢測到可追溯到20世紀(jì)30年代的木薯改良計劃的遺傳特征，其中雜交的木薯和塞阿拉橡膠，以及這些Ceara橡膠區(qū)域在精英木薯品種中的持久性表明它們賦予了理想的特性。他們還闡明了許多栽培木薯品種之間的相關(guān)性，這可以幫助育種者在改良計劃中最大化遺傳多樣性。
      

      “這里描述的變異和種群結(jié)構(gòu)是基于標(biāo)記輔助和基因組選擇的方法的必要輸入，以提高這種主要作物的抗病性和產(chǎn)量，”該團隊指出。共同作者Chiedozie Egisi，前尼日利亞國家根作物研究所，現(xiàn)任康奈爾大學(xué)下一代木薯育種計劃(NEXTGEN木薯)的項目經(jīng)理，最近談到了2016年美國科學(xué)促進(jìn)會的木薯育種( AAAS)年會：
      
			

			
        
      
			
      
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