中文字幕在线天|亚洲一区二区三区手机版|少妇中文字幕乱码亚洲影视|最好看的久久综合伊人



      

      
  

      

      
	
	

      

      



      

	
      

      
	
      
  	       
      
       中國(guó)基因網(wǎng)您的位置：首頁(yè) >行業(yè)動(dòng)態(tài) >        
      
  
      
		
      
			
      新的計(jì)算機(jī)程序可以幫助發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致癌癥的隱藏的基因組改變
      
			
      
				2019-01-24 11:11:40
				?
			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      癌癥很少是單個(gè)基因中單個(gè)突變的結(jié)果。相反，腫瘤起因于基因組中任何數(shù)量的相互排斥的異常變化之間的復(fù)雜相互作用，其組合對(duì)于每個(gè)個(gè)體患者可以是獨(dú)特的。為了更好地描述癌癥基因組變異的功能背景，加州大學(xué)圣地亞哥分校醫(yī)學(xué)院和布羅德研究所的研究人員開(kāi)發(fā)了一種新的計(jì)算機(jī)算法，他們稱之為REVEALER。
      

      新的計(jì)算機(jī)程序可以幫助發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致癌癥的隱藏的基因組改變
      

      該工具在4月18日發(fā)表在Nature Biotechnology上的論文中有所描述，旨在幫助研究人員識(shí)別出與癌細(xì)胞被激活的特定方式相關(guān)聯(lián)的遺傳變異群，或者它們?nèi)绾螌?duì)某些治療產(chǎn)生反應(yīng)。REVEALER可通過(guò)生物信息學(xué)軟件門(mén)戶網(wǎng)站GenePattern.org免費(fèi)提供給全球科學(xué)界。
      

      “這種計(jì)算分析方法有效地揭示了驅(qū)動(dòng)腫瘤形成的基因組改變的功能背景，如基因突變，擴(kuò)增或缺失，”資深作者，加州大學(xué)圣地亞哥摩爾癌癥教授兼聯(lián)合主任Pablo Tamayo博士說(shuō)。中心基因組學(xué)和計(jì)算生物學(xué)共享資源。
      

      Tamayo和團(tuán)隊(duì)使用癌癥基因組圖譜(TCGA)測(cè)試了REVEALER，這是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的基因組信息數(shù)據(jù)庫(kù)，來(lái)自代表許多癌癥類型的500多種人類腫瘤。REVEALER揭示了與已知在腫瘤發(fā)展和對(duì)某些藥物的反應(yīng)中起作用的幾種細(xì)胞過(guò)程的激活相關(guān)的基因改變。其中一些基因突變已為人所知，但其他突變是新的。例如，研究人員發(fā)現(xiàn)β-catenin(一種促癌蛋白)的新活化基因組異常，以及一些癌癥劫持以提高其生存能力的氧化應(yīng)激反應(yīng)。
      

      Tamayo說(shuō)，REVEALER是一種強(qiáng)有力的方法，但需要輸入高質(zhì)量的基因組數(shù)據(jù)和大量癌癥樣本，這可能是一項(xiàng)挑戰(zhàn)。但是，與其他方法相比，REVEALER在檢測(cè)不同類型的基因組特征之間的相似性方面更敏感，并且更少依賴于簡(jiǎn)化統(tǒng)計(jì)假設(shè)，他說(shuō)。“這項(xiàng)研究證明了通過(guò)下一代測(cè)序?qū)⒓?xì)胞功能分析與癌癥基因組特征結(jié)合起來(lái)的潛力，”聯(lián)合資深作者Jill P. Mesirov博士說(shuō)，他是加州大學(xué)圣地亞哥分校計(jì)算健康科學(xué)教授兼副校長(zhǎng)。醫(yī)學(xué)。
      
			

			
        
      
			
      
            鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請(qǐng)第一時(shí)間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。
			
      
			
			
      
        
      推薦內(nèi)容