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      由RNA結(jié)合蛋白調(diào)節(jié)的惡性相關(guān)基因網(wǎng)絡(luò)
      
			
      
				2019-01-22 10:35:42
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      如果他曾做過TED演講，Jeremy Sanford可能不得不為他正在研究的蛋白質(zhì)找到一個更好的名字，這似乎在推動癌細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移方面起著重要作用。目前，它被稱為IGF2BP3，它代表“胰島素樣生長因子2 mRNA結(jié)合蛋白3”。
      

      由RNA結(jié)合蛋白調(diào)節(jié)的惡性相關(guān)基因網(wǎng)絡(luò)
      

      IGF2BP3通常在胎兒組織中有活性，在大多數(shù)成人組織中檢測不到。但是，許多類型的侵襲性癌癥中蛋白質(zhì)的產(chǎn)生被重新激活，并且它與實體瘤和白血病的預(yù)后不良有關(guān)。加州大學(xué)圣克魯茲分校Sanford實驗室的新發(fā)現(xiàn)，他是分子，細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)的副教授，指出了這種蛋白質(zhì)驅(qū)動轉(zhuǎn)移的可能機制。
      

      在5月19日發(fā)表在Cell Reports上的一項研究中，桑福德及其合作者發(fā)現(xiàn)了胰腺癌細(xì)胞中由IGF2BP3調(diào)控的廣泛的惡性腫瘤相關(guān)基因表達(dá)電路。桑福德說：“我們沒有確定相互作用的細(xì)節(jié)，但它提出了IGF2BP3如何通過影響癌癥生物學(xué)相關(guān)基因的表達(dá)來驅(qū)動轉(zhuǎn)移的機制。”
      

      基因表達(dá)涉及幾個步驟，并且調(diào)節(jié)可以在該過程的不同步驟中發(fā)生。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)編碼基因被打開時，其DNA序列被復(fù)制到信使RNA分子中，然后被轉(zhuǎn)化為執(zhí)行特定功能的蛋白質(zhì)。許多調(diào)節(jié)因子控制哪些基因轉(zhuǎn)錄成信使RNA以及何時轉(zhuǎn)錄。不太清楚的是RNA結(jié)合蛋白，例如IGF2BP3，其與信使RNA本身相互作用以在轉(zhuǎn)錄發(fā)生后調(diào)節(jié)基因表達(dá)。
      

      在這項新研究中，桑福德研究小組確定了胰腺癌細(xì)胞中由IGF2BP3調(diào)控的一組164個信使RNA靶標(biāo)。他們發(fā)現(xiàn)大多數(shù)靶向RNA編碼的蛋白質(zhì)在癌癥生物學(xué)中起一定作用，如細(xì)胞遷移，增殖和粘附。
      

      IGF2BP3對不同靶標(biāo)具有不同的作用，增加一些蛋白質(zhì)的表達(dá)并減少其他蛋白質(zhì)。這種雙重活性可能取決于蛋白質(zhì)如何與由稱為微小RNA的短片段介導(dǎo)的重要基因沉默途徑相互作用。微小RNA可以通過與信使RNA結(jié)合來幫助沉默基因表達(dá)，作為被稱為RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RISC)的復(fù)合物的一部分。
      

      “它基本上是一個小分子機器，具有由microRNA制成的引導(dǎo)系統(tǒng)，它通過阻斷信使RNA的翻譯來沉默基因，”桑福德說。“當(dāng)我們繪制IGF2BP3相互作用的位置時，我們注意到它們中的許多與RISC的結(jié)合位點重疊。”
      

      在一些情況下，IGF2BP3可以與微RNA競爭信使 RNA 上的結(jié)合位點，從而干擾沉默復(fù)合物。在其他情況下，IGF2BP3似乎增強了RISC復(fù)合物的功能。
      

      “我們不知道IGF2BP3蛋白如何與RISC復(fù)合物相互作用的確切機制，但它為我們在這個有趣的相互作用網(wǎng)絡(luò)方面進行了大量研究，”桑福德說。“它還表明干擾IGF2BP3與其靶標(biāo)之間相互作用的治療方法可能有效降低某些腫瘤的侵襲性。”
      
			

			
        
      
			
      
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