將植物細(xì)胞從通才轉(zhuǎn)變?yōu)閷<?/h1>
2019-01-09 09:50:49
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隨著正在生長的植物將其根部延伸到土壤中,在其尖端形成的新細(xì)胞具有不同的作用,從運(yùn)輸水和養(yǎng)分到感知重力。一項(xiàng)新的研究指出了這些新形成的細(xì)胞,它們都含有相同的DNA,具有一種特殊的身份。研究人員已經(jīng)在擬南芥植物的根中發(fā)現(xiàn)了一組DNA結(jié)合蛋白,這些蛋白結(jié)合起來幫助前體細(xì)胞選擇性地閱讀相同遺傳文本的不同部分并獲得它們不同的命運(yùn)。在杜克大學(xué)的研究人員的帶領(lǐng)下,該研究為發(fā)育生物學(xué)中一個長期存在的問題提供了線索,即植物和動物如何從同一組指令中制造出如此多的細(xì)胞類型。
植物和動物組織以稱為干細(xì)胞的未成熟細(xì)胞開始。為了使這些非特化細(xì)胞獲得使葉細(xì)胞不同于根細(xì)胞或不同于肌細(xì)胞的血細(xì)胞的特征,它們必須打開不同的基因子集以產(chǎn)生負(fù)責(zé)每種細(xì)胞類型的獨(dú)特性質(zhì)的蛋白質(zhì)。
“這是雞和蛋的問題,”第一作者Erin Sparks說,他是杜克生物學(xué)教授Philip Benfey的博士后助理。如果細(xì)胞開始時它們完全相同,細(xì)胞如何開始打開不同的基因?
Sparks,Benfey及其同事認(rèn)為他們已經(jīng)在擬南芥中找到了一種方法。
擬南芥是白菜和蘿卜的表親,是植物世界的實(shí)驗(yàn)室老鼠。植物的細(xì)線狀根系由大約15種細(xì)胞構(gòu)成,每種細(xì)胞都有自己的一套功能。
由于轉(zhuǎn)錄因子可以根據(jù)需要打開和關(guān)閉基因,因此在給定的時間內(nèi),只有部分植物的30,000個基因在給定的根細(xì)胞中有活性。
該研究的重點(diǎn)是擬南芥中一種稱為“短根”的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,因?yàn)榫哂杏泻π问降亩谈虻闹参锞哂邪l(fā)育不良的根。
在過去的幾十年中,Benfey及其同事已經(jīng)證明短根作為主開關(guān),啟動將通用前體細(xì)胞轉(zhuǎn)化為擬南芥根部某些部位的特化細(xì)胞的過程。
先前的研究發(fā)現(xiàn)短根也會激活其他轉(zhuǎn)錄因子,從而形成一個級聯(lián),其中每個基因調(diào)節(jié)蛋白控制根發(fā)育途徑中的下一個。
研究人員已經(jīng)確定了許多短根的基因目標(biāo),但不確定是什么控制短根主開關(guān)本身開始級聯(lián)。
新的研究表明,答案不在于多種DNA結(jié)合蛋白。
Sparks使用稱為酵母單雜交測定的技術(shù)的修改版本來鑒定超過20種可能與短根基因的啟動子區(qū)域結(jié)合以控制其活性的根蛋白。
果然,具有這些DNA結(jié)合蛋白的突變形式的植物產(chǎn)生具有改變的短根水平的根細(xì)胞。
一些結(jié)合蛋白通過打開短根基因而其他蛋白通過關(guān)閉它來起作用。雖然大多數(shù)這些蛋白質(zhì)存在于多種根細(xì)胞類型中,但研究人員發(fā)現(xiàn),他們在活植物中的統(tǒng)計(jì)模型和實(shí)驗(yàn)表明,在一些細(xì)胞中激活短根主開關(guān)而不是其他細(xì)胞。
“這一切都與激活劑和抑制劑之間的平衡有關(guān),”斯帕克斯說。“這是他們的協(xié)調(diào)效應(yīng),可以打開或關(guān)閉短根。”
斯帕克斯說,類似的機(jī)制也可以啟動其他植物物種的細(xì)胞分化。如果是這樣,它可以使細(xì)胞命運(yùn)對植物遺傳密碼中的隨機(jī)突變更具彈性,即使這些變化使一些基因調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)不能與其預(yù)期的DNA靶標(biāo)結(jié)合。
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