H7N9攜帶稀有H9N2,H7N3,H4N9,H11N9禽流感病毒的基因
由哈爾濱獸醫(yī)研究所陳華蘭教授領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)微生物學(xué)家團(tuán)隊(duì)通過測(cè)試從位于中國(guó)上海和安徽省的活禽市場(chǎng)和家禽養(yǎng)殖場(chǎng)收集的樣本,調(diào)查了新型甲型流感(H7N9)病毒的起源。
2013年3月,H7N9流感病毒在中國(guó)從人類中分離出來。截至2013年4月25日,共報(bào)告了109例實(shí)驗(yàn)室確診的人感染病毒病例。
根據(jù)最近從活禽市場(chǎng)收集的H7N9的研究,這些病毒是重配株,其中六個(gè)內(nèi)部基因來自禽類H9N2病毒。然而,他們的血凝素(HA)和神經(jīng)氨酸酶(NA)基因的起源尚不清楚。
該團(tuán)隊(duì)從位于中國(guó)的活禽市場(chǎng)和家禽養(yǎng)殖場(chǎng)收集了970個(gè)樣本(飲用水,糞便,污染土壤,泄殖腔和氣管拭子)。20個(gè)樣品對(duì)H7N9流感病毒的存在呈陽(yáng)性。所有陽(yáng)性樣本均來自上海的活禽市場(chǎng)。其中10只從雞中分離出來,3只來自鴿子,7只來自環(huán)境樣本。
科學(xué)家對(duì)三種H7N9分離株的完整基因組進(jìn)行了測(cè)序 - 來自雞,鴿和環(huán)境樣本。這些分離株的遺傳分析揭示了所有八個(gè)基因區(qū)段的高度同源性。這些新型H7N9流感病毒分離株的系統(tǒng)發(fā)育分析表明,六個(gè)內(nèi)部基因來源于禽H9N2病毒。
根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù),新分離的病毒的HA基因與來自鴨H7N3流感病毒的HA基因最相似,在核苷酸水平上具有95.2-95.8%的同源性。病毒分離株的NA基因與來自鴨子的H4N9,H11N9流感病毒的NA基因和來自鴨場(chǎng)的環(huán)境樣品具有最高的同源性(97.3-97.9%)。
“很明顯,新型H7N9病毒是基因重配的產(chǎn)物,來自一個(gè)供體的內(nèi)部基因,以及來自一個(gè)或幾個(gè)其他供體的HA和NA基因。”
HA受體結(jié)合特異性是宿主范圍的流感病毒的主要分子決定因素。HA位置226和228處的氨基酸對(duì)流感病毒中受體結(jié)合的特異性至關(guān)重要。在新型H7N9病毒的HA蛋白中,在226位存在亮氨酸殘基,其是人流感病毒中HA基因的特征。
“這一發(fā)現(xiàn)暗示H7N9病毒部分獲得了人類受體結(jié)合特異性。檢查的所有H7N9人分離物在PB2蛋白的627位含有賴氨酸殘基。眾所周知,這種賴氨酸殘基有助于在哺乳動(dòng)物宿主中復(fù)制和傳播禽流感病毒。H7N9病毒在人類宿主中的復(fù)制過程中獲得這種賴氨酸很可能對(duì)它們的毒力和致死性有顯著貢獻(xiàn)。“
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