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皰疹病毒基因研究支持非洲人類遷移理論

2019-01-04 20:20:04 ? 來源：

在北美，歐洲，非洲和亞洲收集的31種單純皰疹病毒1型(HSV-1)菌株的基因組序列支持了“非洲外”人類遷徙理論。

“病毒株的排序與人類基因組測(cè)序的預(yù)測(cè)完全一致。我們發(fā)現(xiàn)所有的非洲分離株聚集在一起，來自遠(yuǎn)東，韓國(guó)，日本，中國(guó)的所有病毒聚集在一起，歐洲和美國(guó)的所有病毒，除了一個(gè)例外，聚集在一起，“大學(xué)的Curtis Brandt教授解釋說。威斯康星大學(xué)麥迪遜分校是開放獲取期刊PLoS ONE上發(fā)表的論文的高級(jí)作者。

“我們發(fā)現(xiàn)的正是人類學(xué)家告訴我們的，以及分析人類基因組的分子遺傳學(xué)家告訴我們的，關(guān)于人類起源的地方以及它們?nèi)绾卧诘厍蛏蟼鞑ァ?rdquo;

對(duì)人類基因組的研究表明，人類祖先大約在15萬至20萬年前從非洲出現(xiàn)，然后向東傳播到亞洲，向西傳播到歐洲。

科學(xué)家以前通過觀察單個(gè)基因或一小群基因來研究HSV-1，但這種方法可能會(huì)產(chǎn)生誤導(dǎo)。這項(xiàng)新研究使用高容量基因測(cè)序和先進(jìn)的生物信息學(xué)來分析來自31個(gè)HSV-1基因組的大量數(shù)據(jù)。

Brandt教授的團(tuán)隊(duì)將基因組分成26個(gè)部分，為每個(gè)部分制作家譜，然后將每個(gè)樹組合成一個(gè)整個(gè)基因組的網(wǎng)絡(luò)樹。正是這種分組與現(xiàn)有的人類遷移分析并行。

結(jié)果甚至可以發(fā)現(xiàn)一些錯(cuò)綜復(fù)雜的遷移。來自美國(guó)的每個(gè)HSV-1樣品除了與歐洲菌株匹配的樣品外，但在德克薩斯州分離的一個(gè)菌株看起來是亞洲的。

“我們是如何在德克薩斯州獲得與亞洲有關(guān)的病毒的?無論是來自遠(yuǎn)東旅行的人，還是來自美國(guó)本土的美國(guó)人，他們的祖先大約在15000年前越過白令海峽的陸橋，“主要作者威斯康星大學(xué)的Aaron Kolb博士說。 -Madison。

“我們發(fā)現(xiàn)了對(duì)陸橋假說的支持，因?yàn)樗c最近的亞洲祖先的分歧日期大約是15000年前。這些日期匹配，所以我們假設(shè)這是一種美洲印第安人病毒，“布蘭特教授補(bǔ)充道。

HSV-1是該研究的理想病毒，因?yàn)樗子谑占?，通常不致死，并且能夠形成終身潛伏感染。由于病毒通過密切接觸傳播，因此往往會(huì)在家庭中傳播。此外，HSV-1比人類基因組簡(jiǎn)單得多，這降低了測(cè)序成本，但其基因組比同樣用于此類研究的另一種病毒大得多。遺傳學(xué)通常歸結(jié)為數(shù)字游戲;較大的數(shù)字產(chǎn)生更強(qiáng)的證據(jù)，因此更大的基因組產(chǎn)生更多的細(xì)節(jié)。

“但真正跳出研究的是明確支持非洲外的假設(shè)。我們的結(jié)果顯然支持人類學(xué)數(shù)據(jù)和其他遺傳數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)解釋了人類如何從非洲進(jìn)入中東并開始從那里傳播，“勃蘭特教授總結(jié)道。

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