CRISPR-Cas9編輯可能導(dǎo)致意外突變
隨著CRISPR-Cas9基因編輯開始進入臨床試驗,由哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的一個研究小組發(fā)現(xiàn),這項技術(shù)可以在基因組中引入數(shù)百個非預(yù)期的突變。
CRISPR-Cas9編輯技術(shù)對于試圖了解基因在疾病中的作用的科學(xué)家來說是一個福音。
該技術(shù)也為更強大的基因療法提供了希望,這些基因療法可以刪除或修復(fù)有缺陷的基因,而不僅僅是添加新的基因。
第一個部署CRISPR-Cas9的臨床試驗?zāi)壳罢谥袊M行,美國的一項試驗計劃于明年開始。
但即使CRISPR-Cas9可以精確地靶向特定的DNA片段,它有時會擊中基因組的其他部分。
搜索這些脫靶突變的大多數(shù)研究使用計算機算法來識別最可能受影響的區(qū)域,然后檢查這些區(qū)域的缺失和插入。
“這些預(yù)測算法似乎在CRISPR-Cas9在培養(yǎng)皿中的細胞或組織中進行時表現(xiàn)良好,但尚未采用全基因組測序來尋找活體動物的所有脫靶效應(yīng),”Alexander Bassuk教授說。,來自愛荷華大學(xué)。
在這項新研究中,Bassuk教授和他的同事對團隊先前研究中經(jīng)過CRISPR-Cas9基因編輯的小鼠的整個基因組進行了測序,并尋找所有突變,包括僅改變單個核苷酸的突變。
科學(xué)家們確定CRISPR-Cas9已成功糾正導(dǎo)致失明的基因,但他們還發(fā)現(xiàn)兩個獨立基因治療受體的基因組已經(jīng)持續(xù)了超過1,500個單核苷酸突變和超過100個更大的缺失和插入。
通過計算機算法預(yù)測這些DNA突變中沒有一種被研究人員廣泛用于尋找脫靶效應(yīng)。
“沒有使用全基因組測序來發(fā)現(xiàn)脫靶效應(yīng)的研究人員可能會遺漏潛在的重要突變。即使是單核苷酸變化可以產(chǎn)生巨大的影響,說:”教授斯蒂芬·曾,來自哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心和基因醫(yī)學(xué)的哥倫比亞大學(xué)的研究所和人類營養(yǎng)學(xué)研究所。
“我們對CRISPR-Cas9仍持樂觀態(tài)度。我們是醫(yī)生,我們知道每種新療法都有一些潛在的副作用 - 但我們需要了解它們是什么,“斯坦福大學(xué)的Vinit Mahajan博士說。
研究人員目前正致力于改進CRISPR-Cas9系統(tǒng)的組件 - 其基因切割酶和將酶引導(dǎo)至正確基因的RNA - 以提高編輯效率。
“我們認(rèn)為科學(xué)界認(rèn)為由CRISPR-Cas9引起的所有脫靶突變的潛在危害至關(guān)重要,包括單核苷酸突變和基因組非編碼區(qū)域的突變,”曾教授說。
“我們希望我們的研究結(jié)果能夠鼓勵其他人使用全基因組測序作為確定其CRISPR-Cas9技術(shù)的所有脫靶效應(yīng)的方法,并研究不同版本以進行最安全,最準(zhǔn)確的編輯。”
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