科學(xué)家對喜馬拉雅土撥鼠的基因組進(jìn)行序列分析
研究人員首次繪制了基因組喜馬拉雅旱獺(喜馬拉雅旱獺),冬眠的哺乳動物棲息在喜馬拉雅山脈的高海拔地區(qū)。發(fā)表在iScience期刊上的結(jié)果暗示了高海拔適應(yīng)和冬眠的遺傳機(jī)制。
“作為海拔最高的哺乳動物之一,喜馬拉雅旱獺長期暴露在低溫,低氧和強(qiáng)紫外線輻射下,”中國西安交通大學(xué)健康科學(xué)中心研究員劉恩琪博士說。
“他們在冬季也會冬眠六個多月。”
這些引人注目的生物學(xué)特征促使劉博士和共同作者將喜馬拉雅旱獺視為研究適應(yīng)極端環(huán)境的分子機(jī)制的理想動物模型。
首先,科學(xué)家們測序并組裝了一個雄性喜馬拉雅旱獺的完整基因組草圖。
他們還重新測序了其他20個喜馬拉雅旱獺,包括生活在高海拔和低海拔地區(qū)的個體以及其他四種土撥鼠。
另外,進(jìn)行RNA測序以比較處于麻痹狀態(tài)和清醒土撥鼠狀態(tài)的土撥鼠之間的基因表達(dá)差異。
這項研究的作者發(fā)現(xiàn)喜馬拉雅旱獺在大約兩百萬年前與蒙古土撥鼠分道揚..
他們確定了兩個基因--Slc25a14和ψAamp(一個加工的假基因) - 在生活在低海拔和高海拔的土撥鼠中選擇了不同的方向,這表明它們與極低氧條件下的高海拔種群的生存有關(guān)。
他們進(jìn)一步表明Slc25a14可能具有重要的神經(jīng)保護(hù)作用。
ψAamp的變化影響編碼基因Aamp的RNA的穩(wěn)定性,這可能是防止在極低氧條件下新血管過度生長的保護(hù)策略。
RNA測序數(shù)據(jù)顯示,在冬眠期間,肝臟和大腦中發(fā)生基因表達(dá)變化。
這些包括脂肪酸代謝途徑中的基因以及血液凝固和干細(xì)胞分化。
“有趣的是,之前的一項研究表明,由于冬眠者的大腦暴露在接近冰點的溫度并且血流量減少,因此血栓的風(fēng)險增加,”劉博士及其同事說。
“他們的腦干細(xì)胞也可能更好地準(zhǔn)備修復(fù)損傷,因為它可以在極端環(huán)境壓力下生存。”
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