中文字幕在线天|亚洲一区二区三区手机版|少妇中文字幕乱码亚洲影视|最好看的久久综合伊人



      

      
  

      

      
	
	

      

      



      

	
      

      
	
      
  	       
      
       中國(guó)基因網(wǎng)您的位置：首頁(yè) >行業(yè)動(dòng)態(tài) >        
      
  
      
		
      
			
      研究發(fā)現(xiàn)僅需1ng血漿cfDNA就可檢測(cè)早期癌癥
      
			
      
				2018-11-16 17:24:43
				?
			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      在一項(xiàng)新的研究中，在加拿大瑪嘉烈公主癌癥中心研究員Daniel De Carvalho博士的領(lǐng)導(dǎo)下，一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)以血液樣本作為測(cè)試對(duì)象，將“液體活檢”、甲基化分析和機(jī)器學(xué)習(xí)相結(jié)合，開(kāi)發(fā)出一種靈敏的基于免疫沉淀的測(cè)試方法來(lái)分析少量血漿循環(huán)游離DNA(cell-free DNA, cfDNA)中的甲基化組(methylome)，從而能夠在癌癥的最早階段檢測(cè)它，并對(duì)它進(jìn)行分類(lèi)。這種測(cè)試方法稱為游離甲基化DNA免疫沉淀高通量測(cè)序(cell-free methylated DNA immunoprecipitation and high-throughput sequencing, cfMeDIP–seq)，用于在不使用亞硫酸鹽的情形下對(duì)血漿cfDNA進(jìn)行全基因組甲基化分析。相關(guān)研究結(jié)果于2018年11月14日在線發(fā)表在Nature期刊上，論文標(biāo)題為“Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes”。
      

      研究發(fā)現(xiàn)僅需1ng血漿cfDNA就可檢測(cè)早期癌癥
      

      de Carvalho說(shuō)，這些研究人員不僅描述了一種檢測(cè)癌癥的方法，而且還有望能夠早在癥狀出現(xiàn)之前，也是癌癥更容易被治療的時(shí)候，更早地發(fā)現(xiàn)它。
      

      de Carvalho說(shuō)，“我們對(duì)這個(gè)階段的發(fā)現(xiàn)感到非常興奮。癌癥的一個(gè)主要問(wèn)題是如何盡早地發(fā)現(xiàn)它。如何在血液中找到十億分之一的癌癥特異性突變，尤其是在早期階段，簡(jiǎn)直是'大海撈針'。這是因?yàn)樵缙陔A段，血液中的腫瘤DNA含量是最低的。”
      

      通過(guò)分析表觀遺傳變化(具體指的是甲基化變化)而不是突變，這些研究人員能夠鑒定出每種癌癥類(lèi)型特有的數(shù)千個(gè)甲基化。隨后，通過(guò)使用大數(shù)據(jù)方法，他們利用機(jī)器學(xué)習(xí)構(gòu)建出一種能夠識(shí)別血液樣本中癌癥來(lái)源的DNA存在并確定哪種癌癥類(lèi)型的分類(lèi)器。這基本上將這種“大海中撈一根針(one needle in the haystack)”問(wèn)題變成了一個(gè)更容易解決的“大海中撈數(shù)千根針(thousands of needles in the haystack)”問(wèn)題，這樣計(jì)算機(jī)僅需找到幾根針，就可確定大海何處有針。
      

      這些研究人員比較了來(lái)自7個(gè)疾病部位(肺癌、胰腺癌、結(jié)直腸癌、乳腺癌、白血病、膀胱癌和腎癌)的300個(gè)患者腫瘤樣本和來(lái)自健康供者的樣本，并分析了血漿循環(huán)cfDNA的甲基化模式來(lái)追蹤癌癥起源和類(lèi)型。在每個(gè)樣品中，“漂浮的”血漿cfDNA與腫瘤DNA相匹配。從那之后，他們已經(jīng)擴(kuò)大了研究范圍，如今已對(duì)來(lái)自更多癌癥類(lèi)型的700多個(gè)腫瘤和血液樣本進(jìn)行了分析和成功匹配。他們還發(fā)現(xiàn)對(duì)1～10ng血漿cfDNA也可成功地開(kāi)展cfMeDIP–seq分析，遠(yuǎn)低于開(kāi)展現(xiàn)有的MeDIP-seq(methylated DNA immunoprecipitation sequencing, 甲基化DNA免疫共沉淀測(cè)序)分析所需的最低100ng DNA。
      

      在實(shí)驗(yàn)室之外，進(jìn)一步驗(yàn)證這種方法的后續(xù)步驟包括分析來(lái)自已在幾個(gè)國(guó)家中開(kāi)展的大規(guī)模人口健康研究的數(shù)據(jù)，其中在這些研究中，血液樣本是在癌癥確診前數(shù)月至數(shù)年收集的。再者，最終還需在癌癥篩查的前瞻性研究中驗(yàn)證這種方法。
      
			

			
        
      
			
      
            鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請(qǐng)第一時(shí)間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。
			
      
			
			
      
        
      推薦內(nèi)容