海水樣本中的eDNA可以揭示深水魚種群的狀況

根據(jù)2016年11月16日在哥本哈根大學(xué)丹麥自然歷史博物館地理遺傳學(xué)中心Philip Francis Thomsen 的開放獲取期刊PLOS ONE中發(fā)表的一項(xiàng)研究，海水樣本中的環(huán)境DNA可提供有關(guān)深水魚類種群的準(zhǔn)確信息。，丹麥和他的同事。極端和深水偏遠(yuǎn)地區(qū)的魚類受到氣候變化和捕撈努力量增加的威脅，因此監(jiān)測(cè)人口非常重要。然而，監(jiān)測(cè)在后勤上可能很困難，目前依賴于入侵技術(shù)，如底拖網(wǎng)捕撈和不可靠的捕撈報(bào)告。因此需要更少侵入性，更可靠的監(jiān)測(cè)技術(shù)。

為了滿足這一需求，Thomsen及其同事評(píng)估了一種替代監(jiān)測(cè)技術(shù)，該技術(shù)依賴于對(duì)海水樣品中的環(huán)境DNA(eDNA)進(jìn)行測(cè)序。他們?cè)谖髂细窳晏m島附近的地點(diǎn)采集海水樣本，深度在188到918米之間，對(duì)這些樣本中的DNA進(jìn)行測(cè)序，以確定存在的魚類。他們比較了這些結(jié)果，以捕獲通過在每個(gè)站點(diǎn)同時(shí)拖網(wǎng)獲得的數(shù)據(jù)。

Thomsen及其同事發(fā)現(xiàn)魚類生物量和豐度的數(shù)據(jù)與eDNA序列豐度相關(guān)。通過拖網(wǎng)和環(huán)境DNA技術(shù)鑒定了26個(gè)魚類家族，包括射線和大比目魚，相比之下，只有兩個(gè)家庭只在拖網(wǎng)捕撈中發(fā)現(xiàn)，三個(gè)僅在eDNA中發(fā)現(xiàn)。環(huán)境DNA采樣也檢測(cè)到格陵蘭鯊魚的豐度高于拖網(wǎng)，這可能表明該技術(shù)可以有效地檢測(cè)到可能逃避拖網(wǎng)捕撈的大型魚類。

環(huán)境DNA采樣需要進(jìn)行進(jìn)一步測(cè)試，以確定其作為監(jiān)測(cè)技術(shù)的有效性。盡管如此，作者表示他們的研究表明eDNA如何用于非侵入性監(jiān)測(cè)，商業(yè)捕魚以及評(píng)估氣候變化對(duì)這些偏遠(yuǎn)生態(tài)系統(tǒng)生物多樣性的影響。

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