新技術(shù)可以擴展我們對人類腸道微生物群的認(rèn)識
許多國際研究人員使用文化遺傳學(xué)來識別新的微生物,包括人體腸道中的大量細(xì)菌。
研究人員利用文化學(xué),首次在2012年推出1。該技術(shù)的開發(fā)是為了解決宏基因組學(xué)的缺點,該基因組學(xué)研究從天然樣品中回收的遺傳物質(zhì)。宏基因組學(xué)已經(jīng)徹底改變了這一研究領(lǐng)域,但其局限性在于無法分配給已知微生物的大量序列的產(chǎn)量。
現(xiàn)在,來自法國,法屬波利尼西亞,沙特阿拉伯,塞內(nèi)加爾和法屬圭亞那的Jean-Christophe Lagier和研究人員確定了1,057個原核物種。他們的研究擴展了已知的人類腸道庫,共有531種:人類已知的146種細(xì)菌,但在腸道中未知,187種細(xì)菌和一種以前未在人類中分離過的古菌,以及197種潛在的新物種,占該物種的20%。這項研究2。
人類被大約1014種細(xì)菌大量定居,其中大部分位于人體腸道中。以前的研究主要集中在確定人體腸道核心微生物群的組成,并研究其中的改變與各種疾病如潰瘍性結(jié)腸炎,結(jié)腸直腸癌和壞死性小腸結(jié)腸炎之間的聯(lián)系。
為了識別不斷增長的人類微生物群落,科學(xué)家們利用微生物文化學(xué),其中應(yīng)用了高通量培養(yǎng)條件,結(jié)合基質(zhì)輔助激光解吸/電離 - 飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF)或16S rRNA擴增和測序
“我們?yōu)樯鐓^(qū)提供了一份禮物......不僅可以了解微生物群,還可以了解它們的功能,”AixMarseilleUniversité高級首席研究科學(xué)家Didier Raoult說。
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