ScarTrace有助于了解多細胞生物如何從胚胎祖細胞中發(fā)育

研究人員開發(fā)了一種使用單細胞測序進行全生物克隆追蹤的新方法。在他們發(fā)表在Nature雜志上的論文中，該小組描述了他們?nèi)绾问褂盟麄兊男路椒▽l形碼斑馬魚細胞進行研究。

正如研究人員指出的那樣，胚胎發(fā)育是人類等高度復雜生物的重要階段 - 只有非常有限數(shù)量的胚胎祖先能夠以某種方式產(chǎn)生所有在成體體內(nèi)結(jié)束的細胞。為了理解這個過程是如何工作的，研究人員進一步指出，需要一些方法來測量發(fā)生的克隆歷史，同時以單細胞分辨率進行細胞識別。在這項新的努力中，研究人員開發(fā)了一種名為ScarTrace的技術。該名稱來自該技術的一部分，該技術涉及添加熒光蛋白轉(zhuǎn)基因的串聯(lián)拷貝，這使得可以鑒定由CRISPR-Cas9基因編輯引起的轉(zhuǎn)錄中留下的“瘢痕”。

利用該技術，研究人員能夠追蹤編碼斑馬魚細胞的克隆根和細胞結(jié)果。更具體地說，他們能夠追蹤成人細胞從幾個部位，如腎臟，眼睛和鰭到特定的祖細胞。他們注意到該技術足夠靈敏，可以研究祖先承諾產(chǎn)生左眼或右眼時發(fā)生的過程。他們還發(fā)現(xiàn)，細胞在皮膚和尾鰭來自同一祖先出現(xiàn)。他們報告了魚鰭中免疫細胞的鑒定，其中克隆來源于其他種類的血細胞。

研究人員提出像他們這樣的方法將有助于追蹤從單個細胞到完全發(fā)育的身體的所有事件的最終目標。支持這一說法的是來自中國，英國和美國的另一個團隊的工作 - 他們在同一個自然問題上發(fā)表了一篇論文，用他們開發(fā)的稱為MAP-seq的單細胞測序方法詳細描述了他們自己的工作。

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