關于逆轉錄病毒宿主共同進化的新知識
逆轉錄病毒通過將其基因插入宿主基因組中而使脊椎動物宿主定居數(shù)百萬年,使其能夠通過世代繼承作為內源性逆轉錄病毒(ERV)。烏普薩拉大學的研究人員現(xiàn)在通過研究野生和家兔群體中的ERV變異和分離,提供關于逆轉錄病毒及其寄主的長期關聯(lián)的新知識。該研究結果發(fā)表在美國國家科學院院刊(PNAS)上。
逆轉錄病毒,例如人類的HIV,必須成為宿主細胞核DNA的一部分,以產(chǎn)生新的病毒。數(shù)百萬年的時間尺度,生殖細胞的逆轉錄病毒浸潤已被宿主的后代遺傳為ERV,其構成了今天脊椎動物基因組的大部分。
研究人員利用最近的技術進展對來自野生和家養(yǎng)宿主的全基因組進行了基于人群的分析,這為ERV-宿主基因組變異提供了新的見解。作為一個模型,研究人員研究了歐洲兔子,它們在大約一百萬年前分化為伊比利亞半島的兩個亞種,大約1000年前在法國南部被馴化。
“通過研究來自相關宿主群體的全基因組序列與單個個體的基因組相比,我們可以識別新的ERV以更好地了解逆轉錄病毒 - 宿主的共同進化,”該研究的第一作者Daniel Rivas說。
利用來自許多兔群的數(shù)百人的數(shù)據(jù),研究人員能夠識別以前未知的逆轉錄病毒插入,并確定參考基因組中存在的那些的擴散。ERV多樣性主要遵循兔差異,結果表明不同兔群體中ERV插入的顯著差異。這一新知識揭示了ERV如何在宿主種群中傳播,以及這種傳播如何與宿主物種的進化相關聯(lián)。
“我們從宿主群體中發(fā)現(xiàn)的豐富和分離變異表明基因組ERV記錄是逆轉錄病毒 - 宿主關聯(lián)的進化觀點的顯著來源,”該研究負責人Patric Jern說。
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