研究發(fā)現(xiàn)用于研究的人類細(xì)胞系之間存在很大差異
根據(jù)Nature在2016年進(jìn)行的一項(xiàng)調(diào)查顯示,超過70%的研究人員未能復(fù)制另一位科學(xué)家的實(shí)驗(yàn)。如果科學(xué)家無法重現(xiàn)彼此的工作,重要的發(fā)現(xiàn)可能永遠(yuǎn)不會(huì)離開實(shí)驗(yàn)室并對(duì)人類健康產(chǎn)生影響。耶魯大學(xué)研究員Yansheng Liu表示,這種“再現(xiàn)性危機(jī)”的一個(gè)原因可能在于不同實(shí)驗(yàn)室使用的細(xì)胞系存在顯著差異。
為了探討這個(gè)問題,劉和一個(gè)國際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)從全球六個(gè)國家的十幾個(gè)實(shí)驗(yàn)室收集了一個(gè)名為HeLa細(xì)胞的人類癌細(xì)胞系樣本。HeLa成立于20世紀(jì)50年代初,是最古老,最常用的人類細(xì)胞系。他們?cè)诰鶆驐l件下培養(yǎng)不同的HeLa細(xì)胞,并通過使用最先進(jìn)的蛋白質(zhì)組學(xué)方法和其他大規(guī)模分析觀察基因表達(dá),生長速率,蛋白質(zhì)功能和其他因素隨時(shí)間的變化。此外,研究小組設(shè)計(jì)了一項(xiàng)實(shí)驗(yàn)來研究細(xì)胞系對(duì)沙門氏菌感染的反應(yīng)。
研究小組發(fā)現(xiàn)不同HeLa細(xì)胞系之間和內(nèi)部存在顯著差異,尤其是稱為HeLa CCL2和HeLa Kyoto的細(xì)胞系。這種變異在基因和蛋白質(zhì)表達(dá)以及細(xì)胞對(duì)感染的反應(yīng)中都很明顯。在一個(gè)特定的菌株中,研究人員觀察到早期一代細(xì)胞和后三代細(xì)胞生長后檢測到的基因表達(dá)差異高達(dá)7%。
這些研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了研究人員需要采取措施將這種變異對(duì)研究結(jié)果的影響降至最低。例如,他們建議報(bào)告研究中使用的特定HeLa細(xì)胞系類型。在其他策略中,Liu及其同事還敦促使用早期細(xì)胞系,記錄細(xì)胞的基本基因組表達(dá),并重復(fù)測試不同樣本或模型或?qū)嶒?yàn)室中的細(xì)胞以確保重復(fù)性。
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