環(huán)狀RNA有望成為癌癥生物標(biāo)志物
隨著新技術(shù)允許研究人員深入研究基因組和外顯子組,一類稱為環(huán)狀RNA的新RNA可能起到一個有趣的作用。
密歇根大學(xué)羅杰爾癌癥中心的研究人員對多種癌癥中的環(huán)狀RNA進行了編目,并進行了初步研究,表明這些穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)可以作為血液或尿液中的癌癥生物標(biāo)志物。
環(huán)狀RNA是一種非編碼RNA,其形成閉合的環(huán)狀結(jié)構(gòu)而不是線性結(jié)構(gòu)。新的RNA測序方法使這些方法變得清晰,對它們起作用的原因或方式知之甚少。但它們的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)使其成為開發(fā)癌癥生物標(biāo)志物的理想候選者。
該研究發(fā)表在Cell上,確定了癌癥中circRNA的概要,為未來研究創(chuàng)建了一個數(shù)據(jù)庫。
“我對環(huán)狀RNA作為非侵襲性生物標(biāo)志物的潛力感到非常興奮。由于它們的穩(wěn)定性,我們可能能夠在癌癥患者的血液或尿液中檢測到這些。這可能對癌癥的診斷或預(yù)后有用,” Arul M. Chinnaiyan,醫(yī)學(xué)博士,博士,密歇根醫(yī)學(xué)中心轉(zhuǎn)化病理學(xué)中心主任和SP??怂共±韺W(xué)教授。
研究人員從超過800個腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)了circRNA,作為MiONCOSEQ計劃的一部分。他們證明了為MiONCOSEQ開發(fā)的捕獲RNA測序在檢測circRNA方面比現(xiàn)有方法更強大。
“捕獲方法可能有限,因為它基于我們用于捕獲RNA的探針。但整個外顯子組捕獲方法使其顯著。我們以這種方式捕獲大量RNA。這就是為什么我們能夠提名如此多的circRNAs以前不知道,“Chinnaiyan說。
該技術(shù)僅需要少量總RNA即能鑒定circRNA。這意味著它可以在稀釋RNA的地方檢測到,例如血液或尿液。
此外,該團隊還發(fā)現(xiàn)了幾種在前列腺癌組織中發(fā)現(xiàn)的circRNA。通過評估來自前列腺癌細胞的circRNA,他們發(fā)現(xiàn)它們比線性RNA更穩(wěn)定。它們也可以在尿樣中檢測到。
“我們能夠證明這些circRNA存在于尿液中并且可以檢測到來自前列腺癌的那些。我們未來的研究將探索這些circRNA作為尿液或血液癌癥生物標(biāo)志物,”Chinnaiyan說。
研究人員將他們的研究結(jié)果轉(zhuǎn)變?yōu)橐粋€名為MiOncoCirc的數(shù)據(jù)庫,對來自腫瘤樣本的報告的circRNA進行編目。該資源可供其他研究人員使用,以幫助開發(fā)新的癌癥生物標(biāo)記物。
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