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      用于單細(xì)胞的新型跟蹤和量化工具
      
			
      
				2019-01-18 10:34:50
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      HelmholtzZentrumMünchen和慕尼黑技術(shù)大學(xué)的科學(xué)家們與蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的同事們合作開發(fā)了一種軟件，可以在觀察細(xì)胞數(shù)周的同時(shí)測量分子特性。該軟件免費(fèi)提供，現(xiàn)已在Nature Biotechnology中引入。
      

      用于單細(xì)胞的新型跟蹤和量化工具
      

      現(xiàn)代細(xì)胞生物學(xué)中的某些問題只能通過專門觀察個(gè)體細(xì)胞的命運(yùn)來回答。例如，研究人員對(duì)干細(xì)胞如何發(fā)展成其他細(xì)胞類型感興趣。由于在某些情況下此類過程需要幾天才能完成，因此使用標(biāo)準(zhǔn)方法進(jìn)行分析(通常只測量過程的單個(gè)時(shí)間點(diǎn))是不夠的。
      

      但所謂的延時(shí)顯微鏡電影的錄制和分析并非易事：“一方面，有必要拍攝足夠的圖像，以免失去對(duì)細(xì)胞的追蹤，另一方面，這導(dǎo)致數(shù)據(jù)量巨大，在某些情況下有數(shù)百萬張圖像，“Fabian Theis博士博士報(bào)道了解釋之前的困境。“因此，我們的想法是將這些新興的大數(shù)據(jù)用于科學(xué)。” Theis是慕尼黑Helmholtz Zentrum的計(jì)算生物學(xué)研究所(ICB)主任，并擔(dān)任慕尼黑工業(yè)大學(xué)生物系統(tǒng)數(shù)學(xué)建模主席。他與總部設(shè)在巴塞爾的蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院生物系統(tǒng)科學(xué)與工程系(D-BSSE)的Timm Schroeder教授一起領(lǐng)導(dǎo)了這項(xiàng)研究。
      

      軟件在線提供
      

      Schroeder自己在亥姆霍茲中心慕尼黑進(jìn)行了研究，直到2013年，并且一直在調(diào)查干細(xì)胞的動(dòng)態(tài)。因此，他非常清楚新軟件能夠做到的事情：“我們整理了兩個(gè)獨(dú)立的軟件包：一個(gè)手動(dòng)跟蹤工具和一個(gè)半自動(dòng)量化工具，用于延時(shí)顯微鏡電影中的單個(gè)細(xì)胞分析。兩者一起允許測量細(xì)胞周期的長度，某些蛋白質(zhì)的表達(dá)動(dòng)態(tài)，以及姐妹細(xì)胞之間這些特性的相關(guān)性。“
      

      就科學(xué)家而言，這些計(jì)劃提供的新可能性應(yīng)盡可能為全世界的研究人員所用。因此，該軟件是免費(fèi)提供的，可以從以下鏈接下載：www.bsse.ethz.ch/csd/software/ttt-and-qtfy.html
      

      盡可能消除技術(shù)障礙。“我們的重點(diǎn)是使應(yīng)用程序也可供沒有后臺(tái)IT專業(yè)知識(shí)的研究人員使用，”Schroeder解釋道。該應(yīng)用程序似乎運(yùn)行良好：兩個(gè)高級(jí)出版物可以追溯到間諜軟件的細(xì)胞。
      
			

			
        
      
			
      
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