Near-atomic埃博拉病毒蛋白質(zhì)的分辨率模型帶來更清晰的理解病毒力學(xué)
沖繩研究所的研究人員科技研究生院(OIST)第一次成像中心的結(jié)構(gòu)組件near-atomic埃博拉病毒的決議。這項(xiàng)研究發(fā)表在《自然》雜志上,是由教授馬提亞狼和第一作者博士Yukihiko杉OIST分子低溫電子顯微鏡的單位(MCEMU)與世界知名的病毒學(xué)家合作教授喜田島Kawaoka(東京大學(xué)和威斯康星大學(xué)麥迪遜分校),北野田佳彥教授(京都大學(xué))和結(jié)構(gòu)生物學(xué)家Hideyuki Matsunami博士(OIST)。
研究人員關(guān)注的一部分病毒核衣殼(NC),一個(gè)復(fù)雜的蛋白質(zhì),作為病毒遺傳物質(zhì)的支撐結(jié)構(gòu)。這個(gè)結(jié)構(gòu)允許病毒復(fù)制其致命的有效載荷,毀滅性的效果。杉田博士孤立nucleoprotein-RNA復(fù)合物,使nc的核心,高度的純度,然后分析它們與低溫電子顯微鏡(低溫電子顯微鏡)一起整日看它們的結(jié)構(gòu)。
“在這項(xiàng)研究之前,我們只知道數(shù)控結(jié)構(gòu)的最小的部分,“杉田博士說,“現(xiàn)在,我們可以看到它作為一個(gè)整體,它可能有助于發(fā)現(xiàn)抗病毒藥物的目標(biāo)。”
完整的埃博拉病毒是一種微小的無形的絲狀結(jié)構(gòu),似乎是受到了短鏈的頭發(fā)當(dāng)放大數(shù)千倍。在這些纖維碎片組成功能病毒:數(shù)控和基質(zhì)蛋白,由表面糖蛋白和病毒包裝信封。
但OIST科學(xué)家和公眾在任何危險(xiǎn)的研究:NP-RNA復(fù)雜生產(chǎn)沒有任何實(shí)際病毒RNA序列在非感染性細(xì)胞生長在biosafety-laboratory OIST,并不代表任何風(fēng)險(xiǎn)。“這就像一輛車的部分,”沃爾夫教授說,“除非底盤、發(fā)動(dòng)機(jī)、車輪等都在一起,沒有效果。這就是我們研究的粒子是最喜歡的組件是缺席。它是無害的。”
先前的研究已經(jīng)分析了數(shù)控結(jié)構(gòu)使用一種稱為電子斷層掃描的技術(shù),但產(chǎn)生的低溫電子顯微鏡重建OIST團(tuán)隊(duì)已經(jīng)高得多的定義,解決個(gè)人RNA的核苷酸和氨基酸側(cè)鏈。“我們的論文顯示首次near-atomic分辨率數(shù)控結(jié)構(gòu)是什么樣子的”狼教授說。
加強(qiáng)團(tuán)隊(duì)的了解,想象看你最喜歡的電影。如果前面的學(xué)習(xí)就像在VHS觀看這部電影,他們的小說結(jié)構(gòu)就像看到4 k表示:細(xì)節(jié)遠(yuǎn)遠(yuǎn)更清晰,清晰的定義,允許科學(xué)家們還得到最詳細(xì)的圖片這個(gè)組件的病毒。
這是一個(gè)緩慢的過程實(shí)現(xiàn)這張照片,然而。“蛋白質(zhì)復(fù)合物非常脆弱,”杉田博士說,“一個(gè)完整的示例非常棘手。”
一旦樣本準(zhǔn)備,團(tuán)隊(duì)超過18個(gè)月才找到正確的方式來重建數(shù)控作為數(shù)字模型。蛋白質(zhì)復(fù)合體的螺旋結(jié)構(gòu)看似簡單,但是它有一個(gè)好復(fù)雜性。在精確的數(shù)量和對(duì)稱的螺旋的幾個(gè)小蛋白質(zhì)構(gòu)建塊可以使整個(gè)模型。但系統(tǒng)的搜索后,幾個(gè)提示另一個(gè)團(tuán)隊(duì)的出版物提供的,和自己的高分辨率分析所提供的新的見解,OIST團(tuán)隊(duì)的辛勤工作得到了回報(bào);一切開槽。
“現(xiàn)在我們有一個(gè)明確的這種結(jié)構(gòu)是什么樣子的,”沃爾夫教授說,“它是更進(jìn)一步弄清楚整個(gè)病毒是如何工作的。”
生成的三維模型從低溫電子顯微鏡圖像為未來的工作提供了準(zhǔn)確的基礎(chǔ)。研究人員現(xiàn)在將能夠精確定位研究埃博拉病毒數(shù)控的整個(gè)結(jié)構(gòu),這可能戰(zhàn)勝病毒的方法。
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