布魯克在Metabolomics 2019上宣布了新的表型組學(xué)解決方案
在Metabolomics 2019年,布魯克重點(diǎn)介紹了創(chuàng)新的質(zhì)譜(MS)和核磁共振(NMR)系統(tǒng)以及用于分子表型和臨床代謝組學(xué)研究的新型高價(jià)值解決方案。
經(jīng)過驗(yàn)證的Bruker IVDr NMR解決方案基于全自動(dòng)化和標(biāo)準(zhǔn)化的600 MHz NMR平臺(tái),特別適用于大規(guī)模,定量代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)化表型組學(xué)研究。
其標(biāo)準(zhǔn)化和自動(dòng)化的Bruker IVDr(BI)方法2.0現(xiàn)已在AVANCE®IIIHD以及最新的AVANCE®NEONMR控制臺(tái)平臺(tái)上提供。BI 2.0方法通過新的血漿和血清定量包BIQuant-PS 2.0進(jìn)一步擴(kuò)展,使用1D NOESY NMR檢測(cè)和定量多達(dá)40種不同的代謝物。BIQuant-PS 2.0提供增強(qiáng)的交互式報(bào)告功能和額外的量化質(zhì)量評(píng)估。
新的BI先天性代謝錯(cuò)誤(IEM)小組僅供研究使用(RUO)。它是與Metagene財(cái)團(tuán)合作開發(fā)的,它可以產(chǎn)生新生兒,兒童和遲發(fā)性成人先天性代謝異常的核磁共振代謝結(jié)果。這些可以與Metagene的近1000種疾病數(shù)據(jù)庫(kù)和兒科轉(zhuǎn)化研究的鑒別診斷進(jìn)行比較。
醫(yī)生博士。Metagene的聯(lián)合創(chuàng)始人,德國(guó)海德堡大學(xué)兒童醫(yī)院教授Friedrich Trefz評(píng)論道:
通過使用Metagene廣泛的數(shù)據(jù)庫(kù)支持轉(zhuǎn)化研究,第一次可以自動(dòng)解釋量化結(jié)果。這在IEM領(lǐng)域是非常新穎的并且具有很高的價(jià)值,因?yàn)镹MR可以同時(shí)檢測(cè)和量化大量化學(xué)上不同的IEM標(biāo)記,否則需要多種常規(guī)分析方法。“
布魯克還宣布推出用于下一代代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)化表型組學(xué)研究的新型MS解決方案。timsTOF Pro系統(tǒng)采用超高靈敏度4D脂質(zhì)組學(xué)方法,可使用PASEF方法在30分鐘內(nèi)進(jìn)行深層脂質(zhì)組分析。
除了從1ul人體血漿中精確定量超過500種脂質(zhì)并具有高精度和可重復(fù)性之外,還可以獲得準(zhǔn)確的碰撞截面(CCS)以創(chuàng)建4D文庫(kù)以便于識(shí)別。
這種方法可以與在無標(biāo)記的SpatialOMx™工作流程中在新的timsTOF fleX系統(tǒng)上從MALDI成像獲得的組織中的空間分子分布相結(jié)合。新的timsTOF fleX通過在單一平臺(tái)上將高空間分辨率MALDI成像與深度4D LC-TIMS-MS / MS多組學(xué)分析相結(jié)合,彌合了分子組織成像和體液分析之間的鴻溝。
使用SCiLS Lab 2020和MetaboScape 5.0軟件,新的自動(dòng)化軟件工作流程將分子組織圖像中的脂質(zhì)和代謝物注釋結(jié)合起來。這使得強(qiáng)大,超高靈敏度的timsTOF fleX成為研究組織脂質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)異質(zhì)性的寶貴研究工具。
一種新的深度發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)工作流程FIA-CASI-MRMS可用于測(cè)定大量未知代謝物的同位素精細(xì)結(jié)構(gòu)(IFS)。由布魯克革命性的scimaX MRMS磁共振質(zhì)譜儀和MetaboScape 5.0軟件提供支持,所選離子(CASI)的連續(xù)累積提供了增強(qiáng)的動(dòng)態(tài)范圍,大大提高了峰密度和靈敏度。
流動(dòng)注射分析(FIA)產(chǎn)生具有IFS明確分子式的組合質(zhì)譜,用于數(shù)千種未知代謝物。FIA-CASI-MRMS發(fā)現(xiàn)工作流程在注釋未知代謝物時(shí)提供前所未有的置信水平,從而更深入地進(jìn)入“暗代謝組”。
結(jié)合MRMS的注釋能力和核磁共振是尿液代謝物結(jié)構(gòu)闡明的從頭策略的基礎(chǔ)。Matthew Lewis博士和倫敦帝國(guó)理工學(xué)院英國(guó)國(guó)家表現(xiàn)中心的研究小組在分析化學(xué)期刊(doi.org/10.1021/acs.analchem.9b00241)中詳述了這種新穎的分子譜分析工作流程。
MRMS為NMR分析提供了高可信度的起點(diǎn),提高了效率并縮短了完整結(jié)構(gòu)解析所需的時(shí)間。該工作還詳細(xì)介紹了一種新型的尿液管道解決方案,該解決方案可促進(jìn)代謝物的提取,濃縮和純化。這為長(zhǎng)期存儲(chǔ)創(chuàng)建了可重復(fù)使用的“分?jǐn)?shù)庫(kù)”,可以在以后進(jìn)行重新分析。
目前,澳大利亞國(guó)家表型中心(ANPC)正在與西澳大利亞州珀斯的布魯克和默多克大學(xué)合作使用類似的分子譜分析工作流程。
對(duì)于其大規(guī)模的代謝表型分析研究,ANPC在Bruker的IVDr平臺(tái)上對(duì)標(biāo)準(zhǔn)化的NMR進(jìn)行了標(biāo)準(zhǔn)化,并對(duì)影響II QTOF“表型組織的主力”進(jìn)行了標(biāo)識(shí),以表征澳大利亞人群中極性和非極性尿代謝物的復(fù)雜混合物。
西澳大利亞健康翻譯網(wǎng)絡(luò)旨在通過多個(gè)Bruker IVDr NMR和Impact II系統(tǒng)開發(fā)世界首屈一指的用于推進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的表型中心,以支持所需的吞吐量增加。
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