大規(guī)模基因組測序縮小了對Strep A疫苗的研究范圍
全球?qū)群鏈球菌(Strep A)疫苗的研究已經(jīng)縮小,此前研究人員通過對跨越10年和20多個國家的項目中的數(shù)千個基因組進行測序,確定了幾乎所有全球Strep A菌株中的共同基因特征。
Strep A是一種細菌病原體,在世界某些地區(qū)是皮膚潰瘍和喉嚨痛的常見原因。在這些流行地區(qū),大部分人口經(jīng)常暴露于鏈球菌A - 未經(jīng)治療可導致風濕性心臟病。澳大利亞原住民是世界上風濕性心臟病發(fā)病率最高的國家之一。
在全球范圍內(nèi),由于侵襲性和免疫介導的疾病,Strep A估計每年導致超過50萬人死亡。
今天發(fā)表于Nature Genetics,由Peter Doherty感染和免疫研究所(Doherty研究所),英國Wellcome Sanger研究所和昆士蘭大學開展的一項研究項目,整理了來自世界各地流行區(qū)的Strep A菌株。
墨爾本大學的主要作者,Doherty研究所和Wellcome Sanger研究所的Doherty-Sanger研究員Mark Davies博士表示,Strep A在地方性環(huán)境中存在知識差距,大多數(shù)關(guān)于細菌病原體的信息來自高收入者在澳大利亞,英國和美國設(shè)置。
我們對流行地區(qū)生活和驅(qū)趕疾病的蟲子知之甚少。因此,過去10年來,我們一直在整理來自世界各地的分離物 - 非洲,太平洋,新西蘭和澳大利亞原住民社區(qū) - 以確定病原體的具體情況,它如何引起疾病以及為什么它在流行地區(qū)有所不同到高收入地區(qū)。“
使用大規(guī)模基因組測序,我們發(fā)現(xiàn)存在超過290種遺傳上不同的臨床重要鏈球菌A譜系,突出了設(shè)計有效的全球疫苗所面臨的挑戰(zhàn)。“
墨爾本大學Mark Davies博士,第一作者
該項目發(fā)現(xiàn)目前領(lǐng)先的Strep A候選疫苗在鏈球菌流行環(huán)境中最需要疫苗的地區(qū)覆蓋范圍有限。
來自Wellcome Sanger研究所和劍橋大學的作者Gordon Dougan教授表示,世界各地數(shù)百萬人受到Strep A的影響。“然而,使用我們收集的所有數(shù)據(jù),我們縮小了全球幾乎所有Strep A株系中常見的基因特征,這是確定可能作為全球候選疫苗的重要一步,”戴維斯博士說。
“這可能會導致一系列疾病,從英國的喉嚨痛和猩紅熱的爆發(fā),到導致澳大利亞土著居民等人群中的風濕性心臟病的感染,”杜根教授說。
“除了幫助研究疫苗外,我們研究的基因組數(shù)據(jù)還將幫助研究人員了解Strep A如何導致疾病,以及為什么高收入地區(qū)與流行地區(qū)不同。”
今年2月,澳大利亞醫(yī)學研究未來基金宣布注入3500萬美元用于推動Strep A疫苗的開發(fā)。
澳大利亞傳染病研究中心主任,昆士蘭大學的Mark Walker教授說,這項研究有可能快速追蹤Strep A疫苗。
沃克教授說:“疫苗開發(fā)人員和更廣泛的科學界現(xiàn)在可以使用我們創(chuàng)建的數(shù)據(jù)庫來確定最常見的基因,以幫助開發(fā)可能有效的A群鏈球菌疫苗。”
“我相信全球疫苗是可能的 - 通過我們和其他研究結(jié)果重新獲得動力,除了增加資金承諾,將增強全球疫苗的推動力。”
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