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計算工具使用患者的基因組數(shù)據(jù)來找到膀胱癌的最佳治療方法

2019-05-11 11:25:58 ? 來源：

我們在照顧患有膀胱癌的患者時面臨的挑戰(zhàn)之一是，從一名患者到另一名患者，預(yù)后，階段和對不同治療方法的反應(yīng)各不相同，”Seth Paul Lerner博士說。泌尿外科腫瘤學(xué)和多學(xué)科膀胱癌項目主任以及泌尿?qū)W教授和貝勒醫(yī)學(xué)院泌尿腫瘤學(xué)教授Beth和Dave Swalm。“在為每位患者選擇最佳治療方案時，多樣化的癌癥特征會帶來挑戰(zhàn)。”

在貝勒，勒納和他的同事一直在研究肌肉浸潤性膀胱癌患者之間這些差異的基因組學(xué)基礎(chǔ)。作為癌癥基因組圖譜研究網(wǎng)絡(luò)小組的一部分，他們在2017年報告了412種肌肉浸潤性膀胱癌的綜合分子特征，結(jié)果確定了五種基于表達的癌癥亞型。研究人員還報告了每種亞型的不同生存結(jié)果。例如，一種名為“神經(jīng)元”的亞型具有非常獨特的表達譜，并且與較差的存活率和較不利的結(jié)果相關(guān)。

“我們能夠證明突變特征，分子亞型，新的癌癥相關(guān)分子的負(fù)荷以及已知的臨床和病理因素對患者的總體存活率有非常明顯的影響，”Lerner說。“但是，我們怎樣才能將這些知識運用到臨床實踐中?”

“在2019年發(fā)表于歐洲泌尿外科的這項研究中，我們報告了計算工具的開發(fā) - 單一患者分類器 - 有效地使醫(yī)生能夠使用該患者的基因組數(shù)據(jù)為個體患者的癌癥分配膀胱癌亞型，”首先說作者Jaegil Kim博士，當(dāng)時他正在研究這個項目時在Broad研究所工作，目前是TESARO的一名高級首席科學(xué)家，TESARO是一家專注于腫瘤學(xué)的公司。

研究人員還將他們的單一患者分類器應(yīng)用于IMvigor 210臨床試驗所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，這些臨床試驗使用atezolizumab(一種免疫治療藥物)治療了近400名局部晚期或轉(zhuǎn)移性膀胱癌患者，并報告了客觀反應(yīng)和總體生存率。這使研究人員能夠?qū)μ囟ò螂装﹣喰椭委煹姆磻?yīng)聯(lián)系起來。

“最令人興奮的發(fā)現(xiàn)之一是，我們在2017年發(fā)現(xiàn)的侵襲性神經(jīng)元表達亞型具有較差的存活率和不太有利的結(jié)果，對阿司佐珠單抗治療反應(yīng)非常好，患者有更好的結(jié)果，”Kim說。

“在我們確定具有神經(jīng)元亞型的11名患者中，所有可評估為客觀反應(yīng)的患者均對治療有反應(yīng)(兩次完全反應(yīng)，六次部分反應(yīng))，或總體為72%。這轉(zhuǎn)化為非常高的生存概率，這是前所未有的在晚期膀胱癌中，“勒納說。“盡管這是一小組患者，但我們的基礎(chǔ)研究可以直接轉(zhuǎn)化為臨床環(huán)境，這使我們能夠確定哪種膀胱癌亞型更有機會對特定治療做出反應(yīng)，這是非常令人興奮的。”

雖然前瞻性臨床試驗需要進一步檢測，但研究人員預(yù)計醫(yī)生可以將單患者分類器應(yīng)用于患者的腫瘤基因組數(shù)據(jù)，以確定膀胱癌的亞型，然后選擇特定亞型最常用的治療方法?？赡軙貞?yīng)。

“膀胱癌每年導(dǎo)致全球約160,000例死亡，我們在其分子數(shù)據(jù)和生物學(xué)的臨床應(yīng)用方面落后于其他癌癥領(lǐng)域，”Lerner說。“但是，我們可以開始了解未來如何使用這些信息為每位患者提供最佳治療方案。”

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