真菌在不同時(shí)間活躍的'父系'和'母系'DNA
許多類型的蘑菇在它們的細(xì)胞中有兩個(gè)不同的細(xì)胞核,一個(gè)來(lái)自'父親',另一個(gè)來(lái)自'母親'。代爾夫特,烏得勒支和瓦赫寧根大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)來(lái)自親本DNA的基因在不同時(shí)間表達(dá)“這意味著,當(dāng)確定參與蘑菇形成的基因時(shí),我們首先需要確定父系或母系核是否活躍,”TU Delft博士候選人Thies Gehrmann說(shuō)。研究結(jié)果發(fā)表在PNAS期刊上。于2018年4月11日。
真菌,如蘑菇,在我們的生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮著重要作用。在自然界中,它們可以回收死去的植物和動(dòng)物作為人類,我們不僅吃真菌,還用它們制作食物,如面包和啤酒,以及用作制造藥物和其他物質(zhì)的生物反應(yīng)器。它們還可以在人類健康中起直接作用,因?yàn)樗鼈兛梢砸鸶腥?。為了充分利用蘑?和整個(gè)真菌)并防止其不良影響,更好地了解真菌是必不可少的。然而,蘑菇是高度復(fù)雜的生物,它們的遺傳過(guò)程也是如此。
在這項(xiàng)研究中,來(lái)自TU Delft,Utrecht和Wageningen的研究人員研究了蘑菇中的基因表達(dá),包括模型蘑菇和普通食用菌。他們研究了TU Delft博士候選人Thies Gehrmann發(fā)現(xiàn)的非凡現(xiàn)象。“許多真菌在它們的細(xì)胞中有兩個(gè)不同的細(xì)胞核,每個(gè)都有不同的遺傳物質(zhì)。一個(gè)蘑菇從父母那里繼承DNA,但這并不像人類那樣混合在一個(gè)細(xì)胞核中。我們現(xiàn)在已經(jīng)看到兩個(gè)親本DNA上的基因在開(kāi)發(fā)過(guò)程中的不同時(shí)間表達(dá) - 這在以前是未知的。“
這一新發(fā)現(xiàn)的影響是,從現(xiàn)在開(kāi)始,首先需要確定在研究蘑菇時(shí)父系或母系核是否活躍,例如在尋求與蘑菇形成有關(guān)的基因時(shí)。這種新的在蘑菇DNA的分子機(jī)制的了解可以用于培育新的菌株,可以提高食用栽培蘑菇,如常見(jiàn)的蘑菇。
PNAS的大部分文章都來(lái)自Thies Gehrmann的論文,他獲得了博士學(xué)位。4月6日星期五在代爾夫特理工大學(xué)。“對(duì)于我的博士研究,我開(kāi)發(fā)并應(yīng)用了生物信息學(xué)分析方法,以了解蘑菇形成真菌內(nèi)部和之間的變異。我們現(xiàn)在在PNAS中描述的現(xiàn)象就是一個(gè)例子。此外,我還證明了另一個(gè)過(guò)程被稱為選擇性剪接,會(huì)引起一些變異。這種現(xiàn)象很難在真菌中研究,因此人們普遍認(rèn)為沒(méi)有進(jìn)行剪接。“
成千上萬(wàn)的案例
選擇性剪接是細(xì)胞中的一個(gè)過(guò)程,它使單個(gè)基因能夠產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì),每個(gè)蛋白質(zhì)都有自己的功能。選擇性剪接產(chǎn)物的異常剪接和突變與小鼠和人類的癌癥,孤獨(dú)癥和嚴(yán)重的發(fā)育障礙有關(guān)。盡管對(duì)哺乳動(dòng)物有這些嚴(yán)重后果,但對(duì)真菌中可變剪接的研究卻很少。Thies Gehrmann現(xiàn)已證明,在真菌S. commune中發(fā)生了數(shù)千例可變剪接。
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